微小巴贝斯虫烯醇化酶蛋白主要特征与抗原表位的生物信息学分析.pdf

中 国 病 原 生 物 学 杂 志 2017年 2月 第 12卷第 2{lfJ Journal0 PathogenBiolog February2017，Vo1．12，No．2 DOI：10．13350／j．cjpb．170210 · 论著 · 微小巴贝斯虫烯醇化酶蛋 白主要特征与 抗原表位 的生物信息学分析* 刘相 叶一 ，郑辰 ，潘志华 ，寇艳波 ，郑葵 阳一 (江苏省免疫代谢重点实验室，徐州医科大学病原生物学与免疫学教研室，江苏徐州 221004) 【摘要】 目的 运用生物信息学方法分析微小 巴贝斯虫烯醇化酶 (BmEno)基 因编码蛋 白的主要特征和抗原表位 。 方 法 运用 ()RFFinder、PROSITE、ProtParam、SignalP、TMpred、SOSUI、MotifScan、Bcepred、HNN等生物信息学存线分 析软件 ，结合 DNASTAR生物信息学分析软件 ，预测 BmEno蛋 白的开放 阅读框 、特征结构域、理化性质、信号肽 、跨膜 区、翻译后修饰位点、可溶性 、亲水性 、表面可及性 、二级结构和抗原表位 。 结果 该蛋 白南 438个氨基酸组成 ，在 349 — 362位存在烯醇化酶的特征结构域 ，分子式为 C H 。N () s。，分子质量单位为 47．5203ku，等 电点理论值 为 5．98，有 25个翻译后修饰位点，l0个亲水性参数得分≥1．9的区域 ，6个柔韧性参数得分≥2．0的区域 ，18个表面可及性 参数得分≥1．9的区域，7个潜在 的B细胞抗原表位 ，15个潜在 的 T细胞抗原表位 ，为可溶性蛋 白。 结论 微小巴贝 斯虫烯醇化酶蛋 白为可溶性蛋 白，有 多个抗原表位 ，具有潜在的免疫原性 ，可 以作为微小 巴贝斯虫的疫苗候选抗原。 【关键词】 微小巴贝斯虫；烯醇化酶 ；理化性质 ；抗原表位 ；生物信息学分析 【中图分类号】 R382 【文献标识码】 A 【文章编号】 1673-5234(2Ol7)O2O136O4 [JournalofPathogenBiology．2017Feb；12(2)：136—139．] Bioinformaticanalysisofthemain characteristicsand epitopesofBabesiamicrotienolase LIU Xiang—Ye，ZHENG Chen，PAN Zhi—hua，KOU Yan—Bo，ZHENG Kui—Yang (JiangsuProvince KeyLaboratoryonImmunometabolism ，DepartmentofPathogenBiologYandImmunology，XuzhouMedicalUniversi— ty，Xuzhou221004，Jiangsu，China) [Abstract] Objective ThemaincharacteristicsandepitopesoftheproteincodedforbytheenolasegeneofBabesiami— crotiwereanalyzedusingbioinformaticapproaches． M ethods A nucleotidesearchprogram wasusedtosearchtheNC— BInucleotidedatabaseforthenucleotidesequenceoftheenolasegeneofB．microti．Theopenreadingframe，specificdo— mains，physicochemicalproperties，signalpeptides，