鱼类miRNAs研究新进展.pdf

第 36卷第 2期 水 产 科 学 Vo1．36NO．2 2017年 3月 FISHERIES SCIENCE Mar．2017 鱼类 miRNAs研究新进展 卢荣华 ，王俊丽。，孙君君。，杨 峰 一，谢帝芝 一，田 雪 一，聂国兴 ， (1．河南师范大学 水产学院，河南 新乡 453007；2．河南省水产动物养殖工程技术研究中心， 河南 新乡 453007；3．河南师范大学 生命科学学院，河南 新乡 453007) 关键词 ：鱼类 ；miRNAs；功能 ；研究进展 中图分类号 ：$917 文献标识码 ：C 文章编号 ：1003—1l11(2017)02—0231—06 MicroRNAs(miRNAs)是一类 内生性的、进化 见表 1。Yang等n 采用 比较基 因组同源性 的方法 上高度保守的单链成熟非编码 RNA，长度约 21～ 对虹鳟的miRNAs进行筛选鉴定 ，发现了 196个潜 25个核苷酸 ，广泛存在植物、动物及微生物 中[1]， 在 miRNAs，隶属于 124个 miRNAs家族 ，其 中189 参与生物体的胚胎形成、个体生长发育 、机体免疫 、 个潜在miRNAs靶基 因数 目为2466个 ，GO富集和 疾病 防御 以及繁殖和糖脂类代谢等生命过程E3-8~。 KEGG分析显示有 2093、2107、2081个靶基 因分别 目前 ，基于生物信息学预测 ，miRNAs约 占整个基 参与细胞组件 、分子功 能和生物过程，这些 miR— 因组 的2％～3％ 。自Lee等 利用定位克隆法 NAs靶基因可能调控 105个代谢途径 ，包括嘌呤代 从秀丽隐杆线虫 (Caenorhabditiselegans)中克隆到 谢 、氮代谢和氧化磷酸化途径 。硬骨鱼类是脊椎动 第 1个 miRNA lin-4基因以来 ，目前在果蝇 (Dro— 物门中数量最大 的一类 ，超过 25000个物种 ，但 目 sophilamelanogaster)、人 (Homosapiens)、家 鼠 前 miRNAs仅在几个硬骨鱼类 中被鉴定 ，这说 明 (Musmusculus)、鸡 (Gallusdomestiaus)、牛 (Bo— miRNAs在鱼类上的研究较为匮乏。 vine)、斑马鱼 (Daniorerio)以及植物的拟南芥 (Ar— 表 1 硬骨鱼类前体和成熟 miRNAs的数■ (miRBasev．20】 abidopsisthaliana)中均分离到了miRNAs。笔者 就 目前 miRNAs在鱼类 中的最新研究进展进行综 述 ，以期为更多的了解其在鱼类 中的作用提供基础 资料 。 l 鱼类 miRNAs的克隆与鉴定 目前 miRNAs在鱼类 中的研究还处于对 miR— NAs的克隆、高通量测序筛选鉴定 以及个别 miR— NAs的初步功能研究阶段 ，如虹鳟 (Oncorhynchus mykiss)、斑 马 鱼 、斑 点绿 河纯 (Tetraodonnigro— viridis)和青鳝 (Oryziaslatipes)等 的多个 miR— NAs已被鉴定 [1¨]。截至 2016年 2月 24 日，在 http：∥www．mirbase．org／cgi—bin／browse．pl中收 2 miRNAs在鱼类中的作用研 究 录的miRNAs数量已达 28645个 miRNAs发夹前 体序列 ，35828个成熟 miRNAs，覆盖 223个物种。 2．1 miRNAs调控鱼类糖脂代谢 其中 9种鱼类 的miRNAs序列被 收录的具体情况 与陆生动物相 比，miRNAs在鱼类糖脂代谢 中 收稿 日期 ：2016-04—14； 修 回日期 ：201607-29． 基金项 目：国家 自然科学基金资助项 目(31372545