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肿瘤流行病学课程
筛选的SNPs在染色体上的分布示意图 457个核心家系 A B C CYP2E1变异对EBV的激活基于家系的关联分析 EBV- VCA-IgA CYP2E1_freq 15.4% CGTGTTAA 1:80 3.32 0.0009 CGTGTTAA 1:40 3.25 0.0012 CGTGTTAA 1:10 2.25 0.0245 CYP2E1 环境压力! EBV激活 NPC 基因型变异与EBV抗体 Variants in DNA Repair Genes are Associated with increased Epstein-Barr Virus Antibody Titers in healthy Cantonese VCA-IgA+ VCA-IgA- (N=128) (N=627) 中山大学肿瘤医院 鼻咽癌病例组 广东省21地区 2006-2007年 2000例-2000例 以医院为基础的病例对照研究设计 标本 血液 漱口水 DNA损伤的主要类型及主要修复通路 从DNA损伤检测及修复通路中筛选出96个基因,其它基因20个: 共116个 Fig. 2. Summary of Cochran-Armitage trend test by Pathway Sub-haplotype association scanning through all 768 SNPs(3 continuous markers/unit) P, means Global p-values for sub-haplotypes,-log10(p) value at 4 indicates very low P-value chr1 chr4 Chr6 Chr11 chr13 chr14 Chr14/15 Chr18/22 chr3 Association study of SNPs across RAD51 CART 分析 基于大样本量多中心的全基因组关联分析 Chromosomal Plot 1977 samples, 3 dialect groups, 465281 SNPs (removed) 1977 samples, 3 dialect groups, 469288 SNPs Trend test 基因-环境-EBV在鼻咽癌发病中的交互作用 美国NIH资助 USD $2,500,000 高发区人群 标本 血液 环境 EBV 遗传 营养素 石蜡块/切片 漱口水 毛发 指甲 开展的鼻咽癌危险因素的流行病学调查 前瞻性随访十年以上,为鼻咽癌的发病因素研究提供A类的研究证据。 收集队列人群的血清、血浆及白细胞样本 研究不同癌前阶段,鼻咽癌患者分子标志物的变化,探索鼻咽癌病因和早期诊断标志物 建立队列人群标本库,开展分子流行病学研究 前瞻性研究 中山2万人 四会2万 目前尚未能开展有效的病因预防 但是对高发区内的高危人群进行二级预防,以达到早期发现、早期诊断,切实可行。 ‘七五’到‘十五’国家科技攻关项目-鼻咽癌高发现场综合防治研究,得到了卓有成效的成果。 研究对1986~1995年鼻咽癌高发区广东省的四会、中山、广州三市98180人进行前瞻性研究[60] 。结果提出了一套适用于高发区人群筛查方案,提高了早期病人检出率和五年生存率、降低了死亡率 鼻咽癌的预防措施 自然人群 头颈部物理检查 EB病毒VCA/IgA 检测 VCA/IgA≧1:5 鼻咽粘膜异常 每2年监测1次 VCA/IgA≧1:80 EDAb≧60% VCA/IgA, EA/IgA, EDAb≧60% 任何两项阳性 VCA/IgA, EA/IgA, EDAb 任何单项持续高滴度或滴度持续升高 高危人群 每1年 监测1次 高危人群 每1年监测1次 染色体畸变率、染色体脆性部 位和姐妹染色体交换率检测 鼻咽光纤镜 病理检查 中、重度异型增生/化生 癌 治疗 癌前病变 每6个月监测1次 肿瘤生物样本库是大的转化研究项目的基石 大的转化研究项目 肿瘤生物样本库 标本资源在转化医学中的应用 基因组DNA 血清 血浆 组织DNA/RNA 石蜡标本 “发现基因难,研究基因的临床意义容易” 肿瘤资源库 (2002年始建) * miRNA profiles of 218 samples from several different tissues were clustered Samples are in columns, miRNAs in rows. Samples of epitheli
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