原创力文档- 1、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
- 4、该文档为VIP文档，如果想要下载，成为VIP会员后，下载免费。
- 5、成为VIP后，下载本文档将扣除1次下载权益。下载后，不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 6、成为VIP后，您将拥有八大权益，权益包括：VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 7、VIP文档为合作方或网友上传，每下载1次， 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等，对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
基于高通量测序的慈竹笋转录组分析与基因功能注释
1610 生 物 工 程 学 报 陈宇鹏 等/基于高通量测序的慈竹笋转录组分析与基因功能注释
Chinese Journal of Biotechnology
/cjbcn November 25, 2016, 32(11): 1610−1623
DOI: 10.13345/j.cjb.160095 ©2016 Chin J Biotech, All rights reserved
生物技术与方法
陈宇鹏，曹颖，胡尚连，黄艳，卢学琴，徐刚，龙治坚
621010
, , , . . , 2016, 32(11):
1610–1623.
Chen YP, Cao Y, Hu SL, et al. Transcriptome analysis and gene function annotation of Bambusa emeiensis shoots based on
high-throughput sequencing technology. Chin J Biotech, 2016, 32(11): 1610–1623.
摘 要: 慈竹是我国四川当地的优势丛生竹种之一，其纤维长度和质量较优异，是造纸、纺织等工业的良好
原料。本文利用Illumina HiSeqTM 2000 平台，对 10、50 、100 和 150 cm 高的慈竹笋进行转录组分析，共得到
69.28 M 条读长 (Reads) ，经从头拼接、组装和聚类后得到 111 137 条非重复序列基因Unigene ，其中共有63 094
条注释到COG 、GO 、KEGG 、Swiss-Prot 和Nr 数据库中。这些Unigene 不仅具有一般的功能，如转录和信号
转导等，还涉及到蔗糖转运与代谢、次级代谢产物及细胞壁的生物合成等方面。不同高度慈竹笋的纤维素合成
酶基因存在差异表达，发现了可能调控慈竹生长发育以及纤维素和木质素生物合成的相关基因，为慈竹品种改
良提供一定的理论基础。
: 慈竹，转录组，高通量测序，功能注释
Received: March 9, 2016; Accepted: July 20, 2016
Supported by: National Natural Science Foundation of China (Nos., Breeding Program Fund Project by the 13th
Five-Year Plan of Sichuan Province, Fund of Engineering Research Center for Biomass Resource Utilizaiton and Modification of Sichuan
Province (Nos. 12zxsk07, 13zxsk01, 14tdgc05), Major Project of Education Department in Sichuan Province (No. 16ZA0145),
Postgraduate Innovation Fund Project by Southwest University of Science and Technology (No. 15ycx089).
Corresponding author: Shanglian Hu. Tel/Fax: +86-138 E-mail: hushanglian@126.com
(Nos.
(Nos. 1
文档评论（0）