基于4300 DNA分析系统的茶树SSR发掘方法优化与建立.pdfVIP

基于4300 DNA分析系统的茶树SSR发掘方法优化与建立.pdf

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茶叶科学 2014 ,34 (5 ):481~488 Journal of Tea Science 投稿平台:ki net 基于4300 DNA 分析系统的茶树SSR 发掘方法优化与建立 张洁茹,韦朝领* 安徽农业大学 农业部茶树生物学与茶叶加工重点实验室,安徽 合肥 230036 摘要:简单序列重复 (Simple sequence repeats, SSR )在茶树遗传与育种研究中具有重要的作用,基于 4300 DNA 分析系统的 SSR 发掘具有通量高、准确和灵敏等特点,已被用于许多物种的分子标记研究,但在茶树 4 的相关研究中尚未见报道。本研究应用单因素试验和L (3 )正交设计试验对影响茶树SSR-PCR 的主要参数进 9 行优化,建立了适合于 4300 DNA 分析系统的茶树 SSR-PCR 反应体系:1.0 μL DNA (25 ng ·μL- 1 ),0.2 μL M13F-F 、0.2 μL R 和 0.4 μL IR-M13F ,0.8 μL dNTPs (25 mmol ·L- 1 ),1.0 μL 10×Buffer (含Mg2+ ),0. 1 μL Ex-Taq 聚合酶 (5 U ·μL- 1 ),无菌水定容至 10 μL 。所有引物浓度均为 1 μmol ·L- 1 。同时,本研究还证明,可 以以自行配制的6.5%聚丙烯酰胺凝胶溶液(acry ∶bis=29 ∶1)替代4300 DNA 分析系统指定凝胶溶液,检测 SSR 位点。 关键词:茶树;4300 DNA 分析系统;SSR-PCR 中图分类号:S571.1 文献标识码:A 文章编号:1000-369X (2014 )05-481-08 Establishment a SSR-PCR System of Tea Plant [Camellia sinensis (L.) O. Kuntze] Based on the 4300 DNA Analysis System * ZHANG Jieru, WEI Chaoling Key Lab of Tea Plant Biology and Tea Processing, Ministry of Agriculture, Anhui Agricultural University, Hefei 230036, China Abstract: Simple sequence repeats (SSR) play an important role in genetic and breeding research for tea plant [Camellia sinensis (L.) O. Kuntze] . 4300 DNA Analysis System is high-throughput, accurate and sensitive in detecting the signals, it has been used in molecular markers techniques in many species, but its application in tea plant has not been reported

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