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Chapter 6 Structures and Functions of Proteins 一、肌红蛋白的结构与功能 二、血红蛋白的结构与功能 三、血红蛋白分子病 四、免疫系统和免疫球蛋白 五、肌球蛋白丝、肌动蛋白丝和肌肉收缩 六、蛋白质结构与功能的进化 Biological functions of protein （1） 催化功能——酶,抗体酶；核酶（ribozyme)是核酸，而不是蛋白质； （2）?运输与储藏功能，如血红蛋白输送氧，肌红蛋白为肌肉输送氧，运铁蛋白负责在血浆中输送铁离子；跨膜蛋白主动运输；细胞色素C传递电子；卵清蛋白、酪蛋白储藏氨基酸； （3）运动功能，如肌球蛋白（myosin）和肌动蛋白（actin）引起肌肉伸缩；细菌的鞭毛或纤毛蛋白推动细胞运动； （4）免疫功能——抗体（antibody）； （5）信号传递功能——受体蛋白（receptor protein)； （6）?调控功能——细胞因子，激素；组蛋白，阻遏蛋白（repressor）； （7）建筑构件——胶原纤维蛋白，细胞膜的组成部分。 一、肌红蛋白的结构与功能 （一）肌红蛋白的三级结构 Myoglobin=Globin（珠蛋白） + Heme（血红素） 一条多肽链，8段?螺旋 MW=16700, 153 A.A. （二）血红素 （三）氧与肌红蛋白的结合以及肌红蛋白构象的变化 血红素如何与肌红蛋白结合？ O2与血红素和肌红蛋白的结合方式（空间位阻） CO中毒的机理？ 肌红蛋白和血红蛋白疏水核心的作用： 1）固定血红素； 2）保护血红素铁免遭氧化； 3）为O2分子提供一个合适的结合部位。 Hill plot and Hill coefficient 肌红蛋白的Hill常数=1.0，表明一个Mb分子结合一个O2；这种结合是独立的，与其他Mb分子的氧合作用无关。 P50 or P0.5 =2 torr for Mb 二、血红蛋白的结构与功能 （一）血红蛋白的三级结构 2条 ?-链（141A.A.），2条? -链（146A.A.） 4个亚基或2个? ?亚基，四聚体或两个二聚体 四聚体疏水洞穴避免Fe 2+被氧化 （二）氧合作用时血红蛋白结构变化-2 2. 氧合对亚基之间相互作用的影响 3. 氧合对各亚基间离子键的影响 8个盐桥断裂 P261 图6-13 （三）血红蛋白(Hemoglobin)输送氧（氧合作用） [O2]n Y = K + [O2]n n---- Hill coefficient 血红蛋白除了输送氧外，还可以携带H+、CO2、BPG 二磷酸甘油酸对Hb氧合曲线的影响(2,3-bisphosphate glycerate, BPG) 别构效应（Allosteric effect） 调节蛋白（regulatory protein） 别构或调节(allosteric or regulatory site)： 两个以上配基； 正协同效应（positive cooperativity）: 如Hb 各配基之间正作用； 负协同效应（negative cooperativity）: 各配基之间负作用； 正效应物或活化剂(activator) 负效应物或抑制剂（inhibitor） Sickle-cell anemia 镰刀状细胞血红蛋白的氨基酸序列变化 镰刀状细胞贫血病 为什么细胞呈镰刀状？ 纤维状沉淀 为什么该病患者早亡？ 地中海贫血病 ? -地中海贫血 缺失? -链 ?-地中海贫血 缺失?-链 四、免疫系统与免疫球蛋白（抗体，Antibodies） 抗体的概念 抗体的分类：IgG, IgA, IgD, IgM, IgE 抗体的结构: 重链、轻链、Fab片段 链内、链间二硫键 The immune system An overview of immune system Humoral and cellular immunity (antibody mediated or cellular) MHC molecules（主要组织相容性复合物分子） Important to study what parts of a protein that binds to MHC molecules. MHC I binds peptides with 8-10 aa MHC II bind peptides with 12-25 aa Potentials of peptide vaccines Prediction of peptides