棉花疫病菌和辣椒疫病菌核糖体基因ITS区域的克隆和序列分析.PDFVIP

南京农业大学学报 　2000 , 23 (3) : 33～36 　 Journal of Nanjing Agricultural University 棉花疫病菌和辣椒疫病菌核糖体基因 ITS 区域的克隆和序列分析 王源超 　丁国云 　马志超 　李德葆 (浙江大学生物技术研究所 , 杭州 310029) 摘要 　采用真菌核糖体基因转录间隔区域 ( ITS) 通用引物 , PCR 扩增棉花疫病菌、辣椒疫病菌核糖体基因的 ITS1 和 ITS2 , 并对 PCR 产物进行了克隆和序列比较。结果表明 : 棉花疫病菌的 ITS1 和 ITS2 分别由 206 和 453 个碱基组成 , 而辣 椒疫病菌则分别由 174 和 432 个碱基组成。棉花疫病菌两个菌株之间 ITS1 和 ITS2 的同源性均高达 100 % , 而棉花疫病菌 和辣椒疫病菌 ITS1 同源性为709 % , 其中中间区域 52～178 bp 在两种间变异丰富 , 同源性只有543 % ; ITS2 在两种疫霉 菌间的同源性为 709 % , 变异均匀分布于全长序列中。 关键词 　棉花疫病菌 ; 辣椒疫病菌 ; 核糖体基因转录间隔区 分类号 　+ Cloning and sequencing of ribosomal RNA gene ITS in Phytophthora boehmeriae and P . capasici Wang Yuanchao , Ding Guoyun , Ma Zhichao and Li Debao (Biotechnology Institute of Zhejiang University , Hangzhou 310029) ABSTRACT 　The internal transcribed spacer regions ( ITS1 and ITS2) of the ribosomal RNA gene repeat from Phytophthora boehmeriae and P. capasici were amplified using the polymerase chain reaction and sequenced. The size of ITS1 in P. boehmeriae is 206 bp , ITS2 is 453 bp. In P. capasici , the total length of ITS1 is 174 bp , ITS2 is 432 bp. The ITS sequences in two P. boehmeriae strains are same. The homology of ITS1 between P. boehmeriae and P. capasici is about 709 % , most difference is among the middle region (52 178 bp) . The ITS2 homology in two Phytophthora species is about 709 %. Key words 　Phytophthora boehmeriae ; Phytophthora capasici ; internal transcribed spacer ( ITS) 疫霉属卵菌 ( Phy top hthora spp. ) 共有 60 多种 , 寄主范围广 , 传播速度快 , 经常导致多种植物的毁 灭性病害。由于疫霉菌的形态和生物学性状具有较大的变异性 , 传统的方法容易误将形态、习性相近 , 但亲缘关系较远的