林木遗传图谱和QTL定位研究进展.pdfVIP

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林木遗传图谱和QTL定位研究进展 施季森 (南京林业大学林木遗传和基因工程重点实验室, 南京210037) 摘要 由于林木具有生命周期长、生物学上大多为异交物种、所处的环境极为复杂多样等 特性,其遗传连锁图谱的构建和QTL定位在技术和方法上难于其他物种,进展相对缓慢。但 近十多年来,林木分子遗传学的研究已有了较大的进展。本文简述了国际林木遗传图谱和 QTL定位研究最新成果的同时,介绍了国内林木遗传图谱和QTL定位研究的进展。 关键词 林木:数量性状基因座位(QTL):遗传连锁图谱: 在寻求社会和经济的可持续发展道路,充分利用自然资源,推行循环经济的21世纪, 林木作为世界上的可再生资源的重要性日益凸显。因此,加速林木的遗传改良和提高林木遗 传改良的效率,是近十年来林木遗传育种科技工作者努力探索的重点领域。虽然林木的生长 周期长、个体高大、遗传背景高度杂合、遗传负荷大等生物学特性,使得林木分子遗传学研 究地落后于其他物种。但是,现代分子生物学技术的迅速发展,极大地推动了林木数量遗传 Trait Loci,QTLs)的 学的发展。遗传连锁图谱的构建和数量性状基因座位(Quantitative 定位研究成为林木数量遗传学的提供了一个重要领域。 I. 林木遗传图谱构建的现状 林木遗传连锁图谱构建研究始于20世纪八十年代后期。首先是美国的科学家在北美重 要用材和纸浆造纸树种——火炬松开始研究。但使用的是同工酶标记,只对部分基因组进行 了作图。直到90年代后期,出现了以DNA为基础的分子标记,如RFLP和RAPD,才使构建 全部基因组的遗传图谱成为可能。林木由于受自身生物学特性的限制,在利用分子标记构建 遗传图谱方面滞后于农作物约十多年,但林木遗传图谱研究进展却非常迅速,仅在几年时 间内,就已在30多个树种中进行了图谱的构建工作。其中以利用RAPD标记技术构图的居多, 占90%左右,还有RFLP标记、SSR标记和STS标记等。现已构图的主要针叶树种有:湿地 松、土耳其松、糖松、长叶松、海岸松、欧洲赤松、北美乔松、长叶松、湿地松、欧洲云杉、 白云杉、短叶红豆杉、花旗松等,阔叶树种主要有杨树、巨桉、尾叶桉等。其中有一些重要 2.林木QTL定位的进展 目前林木数量性状的研究主要针对材性和适应性,材性包括木材的密度、微纤丝角等性 状;适应性包括生长节律、抗病、抗寒、抗旱等性状。 在火炬松和其他一些林木中,木材数量性状遗传的分子分析已经取得了很大的进展。已 经用凹L图谱实验揭示出控制木材密度、微纤丝角等性状的基因数目和这些基因对性状表型 变异的影响,这些分析可以帮助我们了解鉴定控制这些复杂性状基因的范围,另外还需要验 etal 证性实验来确定QTL和遗传背景环境的交互效应(Neale2002)。 在适应性方面,Jermstad(2003)研究了控制花旗松开始生长时间和停止生长时间的 QTL,QTL与光周期、水胁迫、激冷以及适宜温度的交互效应在可控环境条件下得到估计, 每个性状都检测到了中等数量的QTL,每个QTL可以解释高达9.5%的表型变异,其中有两个 QTL与开始生长时间有关,而与停止生长时间有关的QTL则有多个。这是林木上首次有关QTL 与特定环境信号交互作用的研究报道,它将有助于在多年生植物中识别控制这些重要适应性 性状的候选基因。 林木QTL统计分析方法主要借用由近交系而发展起来的QTL定位方法。由于林木的遗传 图谱大多是根据“拟测交”法构建的,因此有关回交群体的QTL作图方法可直接应用于林木 的凹L作图,这些方法包括ANOVA方法、区间作图、复合区间作图等。但是这些方法在林木 上的应用是有缺陷的:第一,由“拟测交”法获得的林木遗传连锁图谱的图距一般比较大, 这样QTL定位的精确性受到限制;第二,回交群体中QTL基因型有两种,一个是纯合的, 一个是杂合的,而林木是高度杂合的,其QTL基因型的数目可能多达四个。 林木作图群体一般属于异交群体,因此有关异交群体的QTL作图方法可用于林木的QTL etal

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