DNA条形码序列对不同品种美国山核桃的鉴定.pdfVIP

江苏农业学报(Jiangsu ofAgr．Sci．)，2013，29(6)：1445—1450 http：／／www．jsrlyxb．corn 1445 陈亚辉 ，朱海军，生静雅，等．DNA条形码序列对不同品种美国山核桃的鉴定[J]．江苏农业学报，2013，29(6)：1445．1450 doi：10．3969／j．issn．1000A440．2013．06．042 DNA条形码序列对不 同品种美国山核桃的鉴定 陈亚辉， 朱海军， 生静雅， 张普娟， 鲍 瑾， 刘广勤 (江苏省农业科学院园艺研究所，江苏 南京 210095) 摘要：选择ITS、ITS2、psbA-tmH、matK4条序列进行评价，以扩增及测序成功率、变异位点数和 k_2．P距离 等指标评价各序列的鉴定能力。此外 ，基于MEGA5分析不同品种美国山核桃序列种间K2P遗传距离并构建 NJ 树。结果显示 ：不 同品种美 国山核桃 4条序列 的扩增及测序成功率扩增均为 100％。不 同品种 的 ITS2和 psbA-trnH序列一致性为 100％，而 ITS和matK序列的一致性分别为99．32％和99．95％，两者均存在较多的变异 位点，可以有效地区分美 国山核桃不同品种。因此 ，ITS和 matK序列可以作为鉴定美 国山核桃不同品种的优势 条形码组合 。 关键词：DNA条形码 ；美国山核桃；品种鉴定 中图分类号： S664．1 文献标识码：A 文章编号： 1000-4440(2013)06．1445-06 IdentificationofpecanvarietiesbyDNA barcoding CHENYa-hui， ZHUHai-jun， SHENGJing—ya， ZHANGPu-juan， BAOJin， LIUGuang—qin (1~thuteofHorticulture，JiangsuAcademyofAgriculturalSciences，Nanjing210014，China) Abstract： TheITS2，psbA-tmH ，ITSandmatK sequenceswereusedforidentificationofpecanvarieties．The PCR amplificationandsequencingefficiency，variationsitesandk-2-PdistancewereemployedtOevaluatetheircapa- bilitiesofidentification．Inaddition，K2PdistanceswerecalculatedandNJTreewasconstructed．Theresultshowed thattheamplificationandsequencingeffieienciesofallpecanvarietieswere100．0％ ．TheidentityofITS2sequence inpecanvarietieswere100．0％ ．andSOdidpsbA—trnH sequence．ThesimilaritiesofITSandmatK inpecanvarieties were99．32％ and99．95％ ．respectively．ManyvariationsitesinITSandmatK couldhelptoidentifypecanvarieties efficiently． Keywords： DNA barcode；pecan；identificationofvariety 收稿 日期 ：2013—10-09 基金项 目：2013年江苏省林业三新工程项 目[1ysx(2013)O6]；2011 薄壳山核桃 [Carayaillinoensis(Wangench)K． 年国家林业公益性行业科研专项基金项 目(201204404)； Koch]，别称美 国山核桃、长 山核桃，在 中国俗称 2012年中央财政林业科技推广示范基金项 目[(2012) “长寿果”、“碧根果”等，属胡桃科山核桃属，是世 TK28]