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2017-12-28 发布于北京
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基于引力场算法的基因调控网络构建.pdf

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基于引力场算法的基因调控网络构建.pdf

第44卷第2期吉林大学学报(工学版) V01·44N。·2 and Edition) Mar．2014 of Technology 2014年3月 JournalJilinUniversity(Engineering 一：=———————————————；———————————————————=——一基于引力场算法的基冈调控网络构建郑明，刘桂霞，周柚，周春光 (吉林大学计算机科学与技术学院，长春130012) 摘要：为了解决传统基因调控网络构建算X-准确度不高且效率低下的问题，使用一种基于微分方程的新型网络构建算法。算法分为奇异值分解和引力场算法两部分，奇异值分解策略用来缩小解空间范围，提高运行效率。引力场算法是本文核心，共分初始化、解空间分解、移动算子和吸收算子4步骤。分解策略采用随机分组法，移动算子采用元素逐个移动法，并可根据收敛效果重新移动。最后，将本文算法与另两种启发式搜索算法下的网络构建进行比较，构建模拟和真实的基因调控网络。实验结果显示：本文算法具有更高的执行效率。关键词：人工智能；引力场算法；基因调控网络；优化算法；奇异值分解中图分类号：TPl8 文献标志码：A 文章编号：1671—5497(2014)02—0427—06 Dol：10．13229／j．cnki．jdxbgxb201402024 on field of networkbased Reconstruction algorithm regulatory gravitation gene ZHENG Gui—xia，ZHOUYou，ZHOU Ming，LIU Chun—guang and 130012，China) 5(_ienceTechnology，JilinUniversity。Changchun (C(，liegeofComputer of low and ofreconstructionGene toresolvethe Regulatory Abstract．Inorder accuracyinefficiency a novelinference from expression Networks(GRNs)inproposed algorithmgene systembiology，we for model．Inthis methodsare inferring databasedondiffcrential employed