束永前-胃癌-新.pptVIP

接下里，我们发现TINCR主要位于胞浆中，通过RIP、Pull down、qPCR等实验发现TINCR与胞浆蛋白STAU1相互作用，通过形成TINCR-STAU1复合体从而降低KLF2 mRNA稳定性和表达量。 接下来，我们通过MTT、克隆形成、流式细胞仪、WB和动物实验表明KLF2通过直接激活细胞周期抑制基因P15和P21从而抑制细胞增殖，促进凋亡。此外，还通过qChIP实验发现KLF2与P15和P21的结合位点分别位于E2和E2/E3间。 我们通过RT-PCR、qPCR和免疫组化发现KLF2在胃癌组织及细胞系中表达水平降低，并通过统计软件分析显示KLF2高的病人患者预后较佳，进展较慢。此外KLF2与TINCR呈负相关。 WHO分型与Lauren分型对应关系 * 肠型和弥漫型胃癌的发生发展过程以及所涉及的分子生物学变化。 * 肿瘤已进入个体化治疗时代，上述的组织学分型已无法满足个体化治疗发展的需求，这使我们迫切的需要寻找一种新的分子分型方法，为胃癌个体化治疗靶向药物的筛选提供依据。 TCGA计划将胃癌分为4种分子亚型，发布与2014年的Nature。研究者收集了295例未经放化疗的原发性胃腺癌患者组织和血液标本，采用6种分子平台对样本进行大量检测和计算，整合数据提出一种胃癌分子分型，将其分为四个亚型：①EB病毒感染型胃癌；②微卫星不稳定型胃癌；根据体细胞拷贝数的变化分为③基因组稳定型胃癌和④染色体不稳定型胃癌； * 上面的流程图所示的是四个亚型中各有多少例患者入组。 EBV感染型占9%，MSI型占22%，GS型占20%，CIN型占50%。 左上图表示的是各亚型在Lauren分型中弥漫型所占的比例。73%的GS型患者Lauren分型为弥漫型。 右上图表示的是各亚型主要分布的区域。CIN型多见于胃食管交界处和贲门处（65%），EBV感染型多见于胃底和胃体（62%）。 左下图表示的是各亚型男性所占比例。EBV型多见于男性（81%），而MSI型多见于女性（56%）。 右下图用四分位间距表示各亚型的年龄分布及中位年龄。GS型患者初诊年龄偏低（中位年龄：59岁），而MSI型初诊年龄偏高（中位年龄：72岁）。 上图最为显著的是在CIN型中受体酪氨酸激酶基因都发生扩增。 * 上图为不同分型中驱动基因表达率，每个基因或受体下的四个比例分别代表的是其在EBV，MSI,GS,CIN四亚型中的表达率。蓝色的(RASA1、PTEN、PIK3R1)为抑癌基因，橘色和红色表示的为癌基因。 四种亚型显示出特有的基因组特征，从而对靶向治疗的选择和临床实验中胃癌病人的分组具有指导性的意义。 胃癌四种分子分型主要特征如上图所示。 非编码RNA的定义及分类：。 ENCODE计划结果表明，人类基因组中有93%的DNA都会转录成RNA，众多转录本为非编码RNA。非编码RNA(ncRNA)是不参与蛋白质编码的RNA的总称，包括微小RNA(miRNA)、piRNA、长链非编码RNA(1ncRNA)、转运RNA(tRNA)、核糖体RNA(rRNA)等。人类基因组中编码蛋白质的基因约占2％，绝大部分转录成长链或短链的ncRNA，这些曾长期被认为是“垃圾”的转录产物，可能对维持机体的正常生理功能、细胞的正常代谢有重要的作用。 真核生物转录组及非编码RNA的概况。RNA转录本包括：编码蛋白的RNA和非编码RNA。非编码RNA又分为：具有调控功能的RNA（miRNA, lncRNA; siRNA; piRNA）;管家性RNA（转运RNA、核仁小RNA、核糖体RNA、催化性小RNA、端粒酶RNA 非编码RNA在不同物种表达。由图可见，随着物种的进化，越高级的物种非编码RNA的含量越高。脊椎动物中非编码RNA含量最高。 非编码RNA可能是基因调控网络的重要元件。计算机和生物医学相结合的生物信息学分析发现人类的基因组之间是一个复杂的调控网络。基于GO（基因功能）及pathway（通路）的分析发现编码蛋白的基因之间组成了复杂的调控网络。而非编码RNA很可能也参与这个复杂网络的调控，使得基因之间的调控更趋复杂化。 下面我们举例说明microRNA在胃癌诊断中的意义。 大量的文献报道，循环血液的microRNA可以作为检测胃癌的重要诊断指标。近3年来，学者发现循环血液中有18中microRNA可作为诊断胃癌的辅助指标，包括mir21,mir451,mir200c等。Meta分析发现mir21的合并ROC的曲线下面积为0.91，敏感性为0.78，特异性为0.89，P值为0.0095.说明循环血液中mir21的上调可能可以作为早期诊断胃癌的指标。 接下来我们举例说明microRNA在胃癌治疗中的意义。 文献报道microRNA表达谱的改变可能影响肿瘤对化疗及放疗的敏感性。Xia等发现miR