生物化学与分子生物学（南方医科大学）DNA的生物合成-1.pptVIP

* * * * * 增加此图，说明相邻片段的连接 * * * * FISH（荧光原位杂交）技术 * * * telomerase_function[1].swf * * 上述源自2004年的nature 文章 现发现的SNP约1500万个， 现认为蛋白编码基因约3万种 Wiki: The haploid human genome contains ca. 23,000 protein-coding genes, far fewer than had been expected before its sequencing.[1][2] In fact, only about 1.5% of the genome codes for proteins, while the rest consists of non-coding RNA genes, regulatory sequences, introns, and noncoding DNA (once known as junk DNA). individual genomes vary by less than 1% from each other * 1958 Crick 70年代发现逆转录 信息流传的单向性 * 。　 * * 来自教材 * * * * Okazaki fragments 1,000-2,000bp in bacteria ?? 100-200bp in eukaryotic cells * * * * * * * * * * * *  * * * * * * * * * * * 首先，DnaA与OriC处的识别位点（9bp重复序列，图3-9）紧密结合，形成起始复合物，通过DNA的弯曲，使DnaA与A－T富含区相接触，使其解链，形成开放复合物，单链结合蛋白（SSB）与解开的单链结合。DnaA还能指导DnaB－DnaC复合物结合到解链区形成前引发复合物，DnaC的唯一功能是运送DnaB蛋白，DnaB具螺旋酶活性，使超螺旋解旋，暴露出引物形成位点，DnaB同时引导引物酶DnaG的结合形成引发复合物，合成RNA引物。Hu因子的作用是促进起始复合物的形成，因螺旋酶能松弛正超螺旋，促进双链解开。以上复合物的形成和解链两个阶段都需要ATP的存在。大肠杆菌质粒的复制起始中，有些需要宿主DnaA和质粒本身编码的复制蛋白共同作用。 2.2.4 真核生物的DNA聚合酶 统一采用希腊字母命名 DNA-pol α：合成引物 DNA-pol γ：线粒体内 DNA-pol δ：负责后续链的合成 DNA-pol β：修复核内DNA DNA-pol ε：负责前导链的合成 …… * Thumb Fingers Palm * 解链过程中正超螺旋的形成 2.3 复制中的解链伴有DNA分子拓扑学变化 * DNA拓扑异构酶 类型 底物 例 子 I A型 单链DNA 大肠杆菌拓扑酶I和III， 酵母和人类拓扑酶III，古细菌反向促旋酶 I B型 单链DNA 真核生物拓扑酶 I II型 双链DNA 大肠杆菌拓扑酶II（DNA促旋酶）和IV；真核生物拓扑酶 IV * I型拓扑异构酶（Type I topoisomerase ） 切断DNA单链后再重新连接，不需ATP。 II型拓扑异构酶（Type II topoisomerase ）切断DNA双链后再重新连接，需ATP DNA拓扑异构酶 * 2.4 解螺旋酶解开DNA双链使成单链 解螺旋酶(Helicase）即DnaB ，又称rep蛋白 与复制相关的基因定名为dnaA, dnaB, dnaC……dnaX。相应的蛋白质命名为DnaA, DnaB, ……DnaX等。 * 2.5 单链DNA结合蛋白( Single-strand DNA-binding protein， SSB) * 2.6 引物合成酶 (Primase) 由大肠杆菌的dnaG基因编码的引物酶(primase)催化引物RNA分子的合成。 * 2.7 DNA连接酶连接DNA双链中的单链缺口 连接酶的特点： 要求一条DNA链有3’自由羟基而另一条链的5’端有磷酸基团； 只能连接双链DNA或DNA-RNA杂交双链中的单链缺口，但不适于双链RNA链中的单链缺口，也不适于单链DNA或RNA间的连接。 * 名称 功能 DNA聚合酶 聚合脱氧核苷酸 拓扑异构酶 理顺DNA链 解螺旋酶(DnaB蛋白，rep蛋白) 解开DNA双链