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Chapter 7 Characteristics of Eukaryotic Genome Chromosomes: DNA 3. The Repetitive DNA content of Genomes (重复DNA序列) tandem repetitive DNA Satellite DNA: Minisatellite DNA Microsatellite DNA Dispersed repetitive DNA 产生原因——转座: 遗传元件在DNA中从一个位置移动到另一个位置的过程 RNA介导——真核存在/原核无 机制: Retrotransposition (反转录转座) 反转录元件 DNA转座子——原核常见/真核少 机制:复制型和保守型 水平基因转移 Figure6.15 Satellite DNA from the human genome Centrifugation(离心分离技术) 常用的两类离心分离方法是 差速离心(differential centrifugation) 密度梯度离心(density gradient centrifugation) Figure6.15 Satellite DNA from the human genome Minisatellite DNA(小卫星DNA)核心序列为25bp ,主要存在于染色体靠近端粒处,与DNA复制有关染色体其他位置的小卫星DNA,功能不清 DNA复制时微卫星拷贝有时发生滑移,导致插入或缺失一个或多个重复单位,使核心序列重复数目发生变化,以至于任何两个不同个体间中都存在串联数目的差异-------可用于DNA Finger(DNA 指纹) 可用来研究人群相关性 Microsatellites are useful for genetic mapping Nucleosomes Nuclease protein analysis of chromatin from hunman nulei The nucleosome components DNA Proteins Histone H1 binds to the linker DNA H1 binds two distinct regions of DNA DNA Must Be Accessed Nucleosome positioning Some Nucleosome are found in special position in vivo. Bent DNA Binds Nucleosomes Reduce the overall positive charge of histone tails Restrain to form higher order chromatin structure (repressive 30nm fiber) Generates the binding sites for protein core DNA: 147 bp linker DNA: 20-60 bp Histones Five abundant histones Structural fold N-terminal “tail” Histones are small, positively charged
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