微生物分类与鉴定-工业微生物学课件-10.ppt

第十章 微生物分类与鉴定 本章内容 一、分类单元 二、命名规则 三、分类鉴定方法 四、微生物的分类系统 据保守估计，地球上 真菌约150万种，细菌4万种，病毒130万种 但认识的微生物仅是估计数量的5~10%，即15万~20万种 要认识、研究和利用类群庞大的微生物资源， 必须对它们进行分类。 分类(classification)：根据一定的原则(表型特征相似性或系统发育相关性)对微生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列成系统，并对各个分类群的特征进行描述，以便查考和对未被分类的微生物进行鉴定。 (根据现有数据建立系统的过程) 分类学的具体任务有三个： 鉴定 分类、 命名、 命名(nomenclature)：是根据命名法规，给每一个分类群一个专有 的名称。 鉴定(identification或determination)：借助于现有的微生物分类 系统，通过特征测定，确定未知的、或新发现的、或未明确分类 地位的微生物所应归属分类群的过程。 (根据现有系统确定未知微生物分类归属的过程) 1. 种以上的系统分类单元 界 门 纲 目 科 属 种（基本分类单元） 一、分类单元 七级 由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准， 为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成的混乱， 细菌系统分类也像其他生物分类一样采用“模式概念” 种和亚种指定模式菌株（type strain）； 如：大量的豌豆根瘤菌(Rhizobium leguminosarum)菌株中，只有菌株 USDA2370才是模式菌株。 亚属和属指定模式种（type species）； 属以上至目级分类单元指定模式属（type genus）. 3.种以下的分类单元 1）亚种(subspecies)和变种(variety)：种内的不同菌株存在少数明显而稳定遗传的变异特征 ，这种差异又不足以区分成新种时，可以细分成亚种或变种。 2）型(form或type)：常指亚种以下的细分。当同种或同亚种不同菌株之间的性状差异，不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。 例如：抗原特征的差异，分为不同的血清型； 对噬菌体裂解反应的不同，分为不同的噬菌体型 3）菌株(strain)：从自然界中分离得到的任何一种微生物的纯培养 物都可以称为一个菌株；用实验方法(如通过诱变)所获得 的某一菌株的变异型，也可以称为一个新的菌株，以便与 原来的菌株相区别。 菌株是微生物分类和研究工作中最基础的操作实体 菌株与型的区别： 菌株之间不存在鉴别特征的差异，命名不同的菌株无需分类学依据； 不同型的细菌之间存在鉴别特征的差异，命名或鉴定不同的型必需有分类学依据。 4）培养物：一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长物，如微生物的斜面培养物、摇瓶培养物。 5）群：一个物种转变成另一个新物种，必然要经过一系列的过度类型，因此在两个不同种微生物之间常出现一些介于两个菌种之间的中间过度类群。通常将这两种微生物和介于它们之间的微生物类群称为群。如大肠菌群。 二、微生物的命名 微生物名称： 俗名（common name） 学名（scientific name） （1）学名国际命名法规： 双名法：属名 + 种名加词 属名在前，一般用拉丁文名词表示，字首字母大写 种名在后，常用拉丁文形容词表示，全部小写 一般用斜体表示 当两个或多个学名排在一起时，若它们的属名相同，则后面的属名可缩写成1个、2个或3个字母，在其后加一个点。 如 ： Bacillus可缩写成“B.” 或“Bac.” 若所分离的菌株只鉴定到属而未鉴定到种，用sp.（单数）或 spp.（复数）表示。 如：Bacillus sp. （2）在分类学文献中 学名=属名+种名+（首次定名人）+现名定名人+现名定名年份 必要（斜体） 可省略（正体） （3）三名法 有亚种或变种时，学名由“三名法”构成 学名=属名 + 种名加词 + subsp 或 var + 亚种或变种的加词 斜体 正体（可省略） 斜体（不可省略） 三、微生物分类鉴定的方法 菌种鉴定步骤： 获得纯培养物 测定必要的鉴定指标 查找权威性的菌种鉴定手册 分类鉴定方法： 经典分类鉴定法 微生物遗传型的鉴定 细胞化学成分的鉴定 现代方法 数值分类法 （一） 经典分类鉴定法