第3章-核酸化学PPT.ppt

5′-磷酸端（常用5’-P表示）；3′-羟基端（常用3’-OH表示） 多聚核苷酸链具有方向性，当表示一个多聚核苷酸链时，必须注明它的方向是5′→3′或是3′→5′。 多聚核苷酸的表示方式 DNA RNA 5′PdAPdCPdGPdTOH 3′ 5′PAPCPGPUOH ′ 或5′ACGTGCGT 3′ 5′ACGUAUGU 3′ ACGTGCGT ACGUAUGU T 5’ 3’ OH U 5’ 3’ OH 第二节 RNA的结构 RNA一级结构研究最多的是tRNA、rRNA以及一些小分子的RNA。其中 tRNA分子具有以下特点： 分子量25000左右，大约由70－90个核苷酸组成，沉降系数为4S左右。 分子中含有较多的修饰成分。 3‘-末端都具有CpCpAOH的结构。 三、RNA一级结构的特点 大多数真核细胞mRNA在3`-末端有一段长约200个残基的多聚腺苷酸（Poly A） 真核细胞mRNA的5`-末端有一极为特殊的帽子结构，称为“帽子（Cap）”：m7GpppNm AA….AA ~200A Poly A 3`-端 5`-端 帽子结构 非编码区 非编码区 编码区 mRNA一级结构的特点： 第二节 RNA的结构 RNA是单链分子，因此，在RNA分子中，并不遵守碱基种类的数量比例关系，即分子中的嘌呤碱基总数不一定等于嘧啶碱基的总数。 RNA分子中，部分区域也能形成双螺旋结构，不能形成双螺旋的部分，则形成突环。这种结构可以形象地称为“发夹型”结构。 在RNA的双螺旋结构中，碱基的配对情况不象DNA中严格。G 除了可以和C 配对外，也可以和U 配对。G-U 配对形成的氢键较弱。不同类型的RNA, 其二级结构有明显的差异。 tRNA中除了常见的碱基外，还存在一些稀有碱基，这类碱基大部分位于突环部分 四、RNA的高级结构 ——RNA分子是含短的不完全的螺旋区的多核苷酸链。 主要特征：1.一臂四环：氨基酸臂：3′端有CCAOH的共有结构；反密码环：环上的反密码子与mRNA相互作用； D环：其上有二氢尿嘧啶（D），与识别酶有关； TψC环：含有T和ψ，与识别核糖体有关； 可变环：其上的核苷酸数目可以变动；2.含有修饰碱基和不变核苷酸，修饰碱基约为10%。 （一）tRNA的二级结构 在三叶草型二级结构的基础上，突环上未配对的碱基由于整个分子的扭曲而配成对，目前已知的tRNA的三级结构均为倒L型 （二）tRNA的三级结构 第三节 DNA的结构 一、DNA的一级结构 因为DNA的脱氧核苷酸只在它们所携带的碱基上有区别，所以脱氧核苷酸的序列常被认为是碱基序列（base sequence)。通常碱基序列由DNA链的5′→3′方向写。DNA中有4种类型的核苷酸，有n个核苷酸组成的DNA链中可能有的不同序列总数为4n。 pAGTOH P 第三节 DNA的结构 二、DNA的双螺旋结构 1953年，Watson 和Crick 提出。 1951年 Franklin和 Wilkins利用X-射线衍射方法分析了DNA的晶体，得到了DNA X-射线衍射图。从衍射图推测出DNA的结构是一个螺旋结构，螺旋沿着螺旋的长轴有两个周期性，第一个周期出现在0.34nm，第二个周期出现在3.4nm。这对于确定DNA的结构是至关重要的线索。 DNA晶体 X-射线衍射图 〈一〉双螺旋结构的主要依据 （1）Wilkins和Franklin发现不同来源的DNA纤维具有相似的X射线衍射图谱。 （2）Chargaff发现DNA中A与T、C与G的数目相等。后来 Pauling 和Corey发现A与T生成2个氢键、C与G生成3个氢键。 （3）电位滴定证明，嘌呤与嘧啶的可解离基团由氢键连接。 （1）DNA分子由两条多聚脱氧核糖核苷酸链(简称DNA单链)组成。两条链沿着同一根轴平行盘绕，形成右手双螺旋结构。螺旋中的两条链方向相反，即其中一条链的方向为5′→3′，而另一条链的方向为3′→5′，螺旋结构上有大沟和小沟。 注：在这些沟内，碱基对的边缘是暴露给溶剂的，所以能够与特定的碱基对相互作用的分子可以通过这些沟去识别碱基对，而不必将螺旋破坏。这对于可以与DNA结合并“读出”特殊序列的蛋白质是特别重要的。 〈二〉双螺旋结构模型要点 （2）嘌呤碱和嘧啶碱基位于螺旋的内侧，磷酸和脱氧核糖基位于螺旋外侧，彼此以3 ′-5 ′磷酸二酯键连接，形成D