转录组与代谢组合结合揭示黄瓜黑刺中次生代谢物质的合成及调控途径-蔬菜学专业论文.docxVIP

缩略词对照表英文缩写英文名称中文名称PCAPrincipalcomponentanalysis主成分分析Nl江RNuclearmagneticresonance核磁共振ACNAcetonitrile乙腈TFATrifluoroaceticacid三氟乙酸AmpAmpicillin氨苄青霉素K矗nKanamycin卡那霉素CbCarbenicillin羧苄青霉素姒Indole．．3．．aceticacid吲哚乙酸KTKinetin激动素ASAcetosyringone乙酰丁香酮eDNAcomplementaryDNA互补DNADEPCDiethylpyrocarbonate，焦碳酸二乙酯ddH20Distilledanddeionizedwater重蒸水EBE曲diumbromide溴化乙锭DEPCDiethylpyrocarbonate，焦碳酸二乙酯DNADeoxyribonucleicacid脱氧核糖核酸RNARibonucleicacid核糖核酸PCRPolymerasechainreaction聚合酶链式反应MSMurashigeandskoogmediaMS培养基mRNAmessageRNA信使RNAoRFOpenreadingframe开放阅读框RifRifampicin利福平TBETris．Boricacid-EDTAbufferTris．硼酸．EDTA缓冲液WTWildType野生型ODOpticalDensity光密度LBLuria-bertanimediumLB培养基bpbasepair碱基对hhour小时万方数据Ssecond秒dday天mMmillimole毫摩尔rpmRevolutionsperminute每分钟转数BLASTBasicLocalAlignmentSearchT001局部序列排比检索基本工具万方数据目录中文摘要I√fIjljSTRACT．．．II1前言．．．．．．11．1研究目的及意义．11．2国内外研究进展11．2．1植物次生代谢研究进展．．11．2．2植物次生代谢分子调控机制研究进展31．2．3环境因素(非生物因素和生物因素)与植物黄酮类化合物的相互影响51．2．4植物激素与类黄酮合成的关系61．2．5黄酮类化合物与植物的抗病性61．2．6转录组学分析流程及应用71．2．7代谢组学研究进展．131．3研究内容及技术路线：171．3．1研究内容171．3．2技术路线．172材料与方法．182．1试验材料．182．1．1植物材料．182．1．2材料种植及定位群体的选择182．1．3菌株及质粒．182．1．4酶及生化制剂182．1．5PCR引物192．2试验方法．．192．2．1黑白刺黄瓜图位克隆定位群体DNA的提取方法192．2．2样品制备及RNA的提取192．2．3RNA提取及eDNA的合成．．202．2．4基因扩增及产物回收j21万方数据2．2．5与克隆载体连接及大肠杆菌感受态DH5cz镰iVJ备与转化。222．2．6DNA序列测定及质粒DNA的提取232．2．7SDS碱裂解法中量制备质粒DNA一242．2．8石蜡切片流程．262．2．9黄瓜黑白刺代谢物提取及液质连用方法273结果与分析。283．1黄瓜果实黑白刺表型观察及果皮颜色变化283．2黑刺白刺RNA提取及转录组分析313．2．1黑白刺RNA提取及检测313．2．2高通量测序质量评估．323．2．3READS与参考基因组比对情况统计333．2．4基因表达水平分析353．2．5差异表达基因分析．353．2．6GENEONTOLOGY功能富集分析．373．2．7KEGG富集分析383．2．8KEGG相关代谢途径基因表达分析393．2．9蛋白互作网络分析453．3．1黄瓜黑刺物质代谢网络图473．3黑刺形成基因的定位．483．4黄瓜黑白刺代谢组分析503．4．1PCA主成分分析503．4．2模型累计比例预测513．4．342种差异代谢物513．4．4核磁结构鉴定574讨论．．．!；84．1黑刺形成基因的定位s84．1．1定位群体的构建584．1．2通过转录组进行SNP与表型的关联分析594．2代谢组分析s94．3黄瓜黑刺形成分子调控机制。60万方数据4．4研究展望。6l5结论．．．。。636参考文献。“7致谢。738lf|录．．．．．。。．．．749攻读学位期间发表论文情况86万方数据山东农业大学博士学位论文中文摘要果刺颜色是黄瓜(CucumissativusL．)非常重要的外观品质。虽然前人研究结果已揭示黄瓜黑刺对白刺为显性性状，且由一对等位基因控制，但是，黑刺中黑色物质是何种组分，以及这些物质对黄瓜本身和人类的健康有何影响，都还不清楚。因此，了解黄瓜黑刺中的代谢组分，以及它们的合成及调控途径，具有重要的理论意义。本研究利用黄瓜黑