马氏珠母贝有效亲本数量估计与近交家系遗传结构研究-estimation of the number of effective parents of pinctada martensii and study on the genetic structure of inbreeding families.docxVIP

马氏珠母贝有效亲本数量估计与近交家系遗传结构分析 摘 要 由于马氏珠母贝产卵量高，在育苗过程中常常使用少数量亲本进行苗种培育，较 低的有效亲本数量（或者有效群体大小）会增加群体的近交和遗传漂变的程度，降低 群体的遗传多样性，影响育种效果。因此，控制好适当的有效亲本数量，是成功开展 遗传育种工作的重要前提，利用分子标记分析群体的遗传结构，估计养殖群体有效亲 本的数量，能够为育种工作及时进行评估。本研究利用 SSR 标记调查了马氏珠母贝 不同群体（野生与养殖群体）与不同生长阶段选系的遗传结构，估计了群体的近交率 与有效亲本数量，并比较研究了近交家系遗传结构的变化，主要结果如下： 1、野生与养殖群体有效亲本数量估计 实验群体分别为大亚湾野生群体、北部湾涠洲岛野生群体与 3 个养殖群体，分别 从这 5 个群体取样 48、24、48、48 与 48 个个体，利用 8 对 SSR 引物分析了群体的 遗传结构、近交率并估算了群体有效亲本数量。结果显示：1）8 个 SSR 标记在 5 个 群体中检测到 22-29 个等位基因，平均每个位点检测到 2.750-3.625 个等位基因，每个 位点等位基因数在 2 到 5 之间；2）5 个群体的平均期望杂合度为 0.3387-0.5025，平 均观察杂合度为 0.2917-0.4219；3）运用同胞重建的方法，估算这 5 个群体的有效亲 本数量分别为：11、15、16、19 和 20，近交系数 ΔF 分别为：0.045、0.033、0.031、 0.026 和 0.025，五个群体的有效亲本数量较少，近交系数高。 2、不同生长阶段选系有效亲本数量估计 亲本来源于从大亚湾收集的野生群体，选取 50 个亲本（雌、雄亲本数量分别为 30 个与 20 个），解剖性腺，人工授精。按照常规技术幼体培育与海区养殖。在 D 型 幼虫期、附着变态期与稚贝期取样，利用 10 对 SSR 标记分析选系遗传结构，估计有 效亲本数量。结果表明， 3 个生长阶段，每位点的平均等位基因数分别为 3.75、3.8 和 3.6，平均观察杂合度分别为 0.3242、0.5135 和 0.3719；有效亲本数量的估计分别 为 38、28 和 30，三个发育阶段估算的有效亲本数量均比实际所用到的亲本数量少， I PAGE PAGE IV 并且附着变态期和稚贝期的有效亲本数量相较于 D 型幼虫期而言有了显著的降低；近 交系数ΔF 分别为 0.013、0.018 和 0.017，附着变态期和稚贝期的近交系数相较 D 型 幼虫期而言增加了 0.5%和 0.4%。 3、近交家系遗传结构比较 以两个全同胞家系个体（A 和 B）为亲本，按照因子设计构建如下四个家系，1 号家系：A♀×A♂；2 号家系：A♀×B♂；3 号家系：B♀×A♂；4 号家系：B♀×B♂，使 用 13 个 SSR 标记比较了 4 个家系的遗传结构。结果表明 4 个家系的平均观察杂合度 分别为 0.5064、0.5609、0.5692 和 0.5064，近交家系遗传多样性低于杂交家系，发生 了一定的近交衰退；并且发现在 1 号和 4 号近交家系中各有 1 对标记可作为该近交家 系的标志位点。 关键词：马氏珠母贝，SSR，有效亲本数量，近交家系，遗传多样性 The effective population size in the stocks and Genetic variation of Inbred families of pearl oyster Pinctada martensii Abstract Pearl oyster Pinctada martensii is high fecundity. A small number of breeders are commonly used to produce progeny stock in the hatcheries. The restricted number of effective population size (or effective number of breeders) can lead to increase in inbreeding and genetic drift and loss of genetic variability, which will influenced the progress of breeding. Control a proper effective population size is important for breeding progress，and analysis of the genetic structure and the effective