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黄顶菊活性成分构型及其除草活性作用机制
黄顶菊活性成分构型及其除草活性作用机制
摘要:黄顶菊提取物中含有除草活性成分,针对这些活性基团合成一些具有除草活性的分子,采用B3lyp/6-311G(d,p)对7种化合物进行全参数优化,得到其稳定构型。并对化合物中原子的NBO电荷分布、前线分子轨道能级、静电势等性质进行了分析,结果表明,化合物的除草活性与分子的各种参数存在一定的联系,药物分子与受体作用时是噻吩环接受电子,苯环、吡啶环或嘧啶环提供电子,达到药物的作用效果,在药物分子发挥药效时主要是连在苯环、吡啶环或嘧啶环酰胺基这部分提供电子,与蛋白质或酶相互作用形成电子转移过程,从而达到除草效果。
关键词:黄顶菊;除草活性;量子化学研究;前线分子轨道
中图分类号: O621.13文献标志码: A文章编号:1002-1302(2016)06-0226-03
收稿日期:2015-12-14
基金项目:国家自然科学基金 (编号;河北省保定市科技局指导性计划(编号:13ZF080)。
作者简介:王俊敏(1978―),女,河北景县人,硕士,讲师,主要从事物理化学研究。E-mail:wang_jm12@163.com。黄顶菊也称为“生态杀手”,黄顶菊所分泌和释放的化感物质对马唐、反枝苋、棉花、玉米等具有很强的抑制作用。对黄顶菊的研究多集中于光合生理特性,而关于黄顶菊提取物的研究相对较少,已有报道表明黄顶菊的提取物具有杀虫活性[1-2]和杀菌抗病毒活性[3]。国内对黄顶菊的研究多集中于生物学、发生特点与危害等方面[4]。已经明确了外来入侵植物黄顶菊中具有较高除草活性的新型结构,并从黄顶菊的提取物中分离得到了活性较强的化感物质[5],笔者所在项目组通过分子设计和衍生合成了7种有机分子,并得到这些药物分子对油菜、马唐的除草活性数据。通过量子化学计算可以从理论上对药物的活性部位进行分析,为了明确这些药物的除草活性及作用机制,采用密度泛函理论(DFT) 中的B3LYP 方法,对化合物中原子的NBO电荷分布、前线分子轨道能级、静电势等性质与除草活性的关系进行了分析,阐明了这些分子的构效关系与作用机制,为进一步改造药物结构提供理论依据,而且也为除草剂的创新提供新的分子源,促进新型除草剂的研制。
1计算方法
计算使用Gaussview软件构建出7种待分析化合物的结构,运用密度泛函理论DFT/B3LYP方法,在6-311G(d,p)基组水平上,化合物进行分子的全参数几何优化,对计算结果的频率分析显示无虚频,说明已经得到能量最小的稳定构型[6]。全部计算工作用Gaussian03[7]程序完成。
2结果与分析
2.1优化后化合物的稳定构型及参数的选取
以分子经过优化后的稳定结构为基础,计算了各分子的NBO电荷,轨道能量,并从计算结果中提取出EHOMO(最高占据轨道能)、ELUMO(最低未占据轨道能量)、ΔE(轨道跃迁能,即ELUMO-EHOMO),分子的偶极矩、四级矩以及分子的药物活性数据列于表1中,各种轨道图以及分子的静电势图见图1。
2.2分子前线轨道能量分析
根据分子轨道理论及福井谦一的前线轨道理论,对分子活性影响最大的是最高占据轨道和最低未占据轨道,活性分子与目标分子反应时,主要是在分子前线轨道附近发生。农药分子的前线轨道能量对分子的活性有较大的影响,EHOMO过低或ELUMO过高都可能导致农药分子的活性过强,从而容易被分解或与其他受体作用,影响效果。所以,对于农药分子而言,EHOMO或ELUMO值应该在一定的范围内[8-9]。
从表1数据来看,EHOMO能级最高的是化合物3,化合物的供电子能力随着EHOMO能级的升高而增强,这就会使分子活性过强,从而在与受体作用时易被分解;ELUMO能级最高的是化合物1,化合物接受电子的能力随ELUMO能级的升高而减弱,当药物与受体作用时,化合物接受受体提供的电子较为困难。此分析结果与实验值相符。根据已经取得的活性数据,化合物5、化合物6的生物活性较高,这与量子化学计算结果相吻合,即化合物5、化合物6具有较低的EHOMO能级,且ΔE值相对较低,当药物分子与受体接触时,可以稳定地给受体提供电子,形成电子转移配合物,以保证药效的发挥。化合物2的ΔE值较高,为4.83,活性较低,这与活性数据相符合。从偶极矩和四级矩数据看出,其数据规律和前线轨道数据规律一致,分子的极性也是影响药物活性的因素。
图2是通过计算并绘制得到的这7种化合物的 HOMO、LUMO轨道图。从图2可以看出,分子的LUMO主要由噻吩环组成,HOMO多集中在苯环、吡啶环、嘧啶环上。这说明药物分子与受体作用时是噻吩环接受电子,苯环、吡啶环或嘧啶环提供电子,形成配合物,达到药物的作用效果。从 HOM
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