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脆性X智力低下基因FMR1中不稳定DNA序列的研究
李斌元,马云,何淑雅,钟南,孙春莉,闵凌峰中华实用医药杂志
*基金项目:国家自然科学基金(编号和湖南省自然科学基金(01JJY1002)资助项目。
作者单位:1421001湖南衡阳南华大学生化与分子生物学教研室(Δ通讯作者)
2美国纽约州立基础研究所人类遗传研究室
【摘要】目的检测脆性X染色体综合征智力低下基因FMR1中(CGG)n拷贝数的多态性。方法采用PCR结合序列胶银染法、Southernblot杂交分析法,对299条表型正常的湖南省人群X染色体FRAXA位点(CGG)n拷贝数的多态性及分布频率进行了测定和验证。结果显示其范围为20~40,高峰为28,PCR-序列分析银染法结果与Southernblot法结果完全一致。结论检测了湖南省人群X染色体FRAXA位点(CGG)n拷贝数的多态性;运用PCR-序列分析胶银染法快速、直接、简便、实用,适合脆性X综合征的大规模群体筛查。
【关键词】脆性X综合征FMR1(CGG)nPCR
ThestudyoftheunsteadyDNArepeatlocatedinthementallyretardantFMR1geneoffragileX
LiBinyuan,MaYun,HeShuya,etal.
TheEducationalandResearchRoomofBiochemicalandMoleculeBiology,NanhuaUniversity,Henyang,Hunan421001.
【Abstract】ObjectiveTodetectthepolymorphismofCGGrepeatslocatedinthementallyretardantFMR1geneoffragileX.MethodsTodetectandtestthepolymorphismandfrequencyofCGGrepeatslocatedintheFRAXAregioncomefrom299chromosomeofnormalhunanpupulations.ResultsThenormalrangeofCGGrepeatsis20-40,themeannumberis28,thedatashowedthattheresultsofPCR-sequencegelsilverstainingwasthesameasthoseofPCR-Southernblot.ConclusionRealizethepolymorphismofCGGrepeatslocatedintheFRAXAlocus;2.ThePCR-Sequencegelsilverstainingwasmorerapid,immediate,simpleandeconomy,whichsuitstothecolonyscreeningfragileXsyndromeonalargescale.
【Keywords】fragileXsyndromeFMR1CGGrepeatsPCR
脆性X综合征(fragileXsyndrome,FraX)是常见的遗传性智力低下性疾病之一,其发病率仅次于唐氏综合征。在人群中男性的发病率约为1/4000[1],女性的发病率为1/2500[2]。其在细胞学上主要表现为Xq27.3带处有一细丝样的脆性位点(FRAXA)[3],在分子水平上表现为FMR1基因5’端(CGG)n的异常扩增。(CGG)n在正常人群体中呈多态性,n=6-50,当n=50-200时为前突变,n>200时为全突变,同时伴随其周围CpG岛异常甲基化[4]。我们根据FraX基因致病特点,通过测定湖南省人群中CGG重复序列,了解其分布的多态性,并建立一个简便、快捷的基因检测方法。
1材料和方法
1.1研究对象及标本208名人群为本校附属医院门诊自愿受检者,男117名,女91名,年龄24~56岁,平均36.5岁。分别从肘静脉抽取血1~2ml,以草酸钾抗凝,标本按碘化钾法提取DNA。
1.2主要试剂T4多聚核苷酸激酶、PBR322/MSPI、7-deaza-dGTP等均为NEB公司产品,杂交液、尼龙膜、PCR扩增相关试剂均购自上海生工,探针PE5.1由美国纽约州立发育不全基础研究所NanbertZhong博士惠赠。
1.3PCR扩增PCR引物设计参照文献[5],在FMR1基因内(CGG)n重复区域两侧合成引物。其中上游引物为:5’-GGAACAGCGTTGATCACGTGACGTGGTTTC-3’,下游引物为:5’-GTGGGCTGCGGGCGCTCGAGG-3’。反应体积为20μl,其中包括10×PCR缓冲液,50~100ng模板,每种引
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