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实验一 实验要求与生物安全
(一)实验前准备——预习并复习PCR的反应原理及基本过程
(二)实验要求——严肃认真、安全规范
1、不迟到早退、不无故缺席、按要求着白大褂
2、保持安静和秩序、不在教室接听手机和喧哗
3、听从安排,严格遵守操作规程
4、公用物品及时放回
5、爱护仪器设备、保持清洁卫生
6、注重仪器和试剂使用的安全
操作中注意事项:
注意无菌操作并防止RNase污染
注意移液器(枪)的使用
注意离心机必须平衡
防止试剂造成皮肤伤害
实验二 乙型肝炎病毒(HBV)核酸扩增(PCR)荧光定量检测
【标本采集】
样品可采用血清或血浆样本,血浆采用3%枸橼酸钠抗凝,抗凝剂:血液为1:9。
【操作步骤】
待测样品处理(将[阴性对照]、[工作标准品①]、[工作标准品②]、[工作标准品③]、[工作标准品④]与待测标本同步进行处理)
(在标本处理区进行)
1.1 用带滤芯吸嘴吸取100μl[样品处理液A]于0.5ml离心管中。
1.2 加入100 μl被测标本。
1.3 盖上管盖,振荡混匀,13000rpm离心10分钟(离心时固定离心管方向)。
1.4 吸弃上清(沉淀不明显,需在离心管底部沉淀对侧吸上清,应一次吸尽上清,避免搅动或碰到沉淀)。
1.5 再加入25μl[样品处理液B]。
1.6 振荡混匀,低速(2000rpm)离心数秒后,100℃干浴或沸水浴10
1.7 13000rpm离心10分钟,取上清为PCR反应模板。
(上清如不立即使用,须置-20℃保存,重新使用时需13000rpm离心10
2. PCR试剂准备(在PCR前准备区进行)
2.1 取试剂盒中[PCR反应液A]、[PCR反应液B]、[PCR反应液C]室温融化混匀后,低速(2000rpm)离心数秒。
2.2 根据待扩增样品数按[PCR反应液A]:[PCR反应液B]:[PCR反应液C]=13.5:13.5:1的比例配制PCR反应液,并分装至PCR反应管中,每管28μl,将装有PCR反应液的反应管转移至标本处理区。
3. 加样(在标本处理区进行)
在装有PCR反应液的反应管中用带滤芯吸嘴分别加入2μl已处理好的标本(标本处理步骤1.7的上清)。盖上管盖,转移到扩增检测区。
4. PCR扩增检测(在扩增检测区进行)
将反应管放入荧光PCR扩增仪进行扩增检测。
循环参数设定:(请参照各类仪器的操作软件进行设置)
步骤
温度
时间
循环数
1
UNG酶反应
50
2分钟
1
2
预变性
94
2分钟
1
3
变性
94
10秒
40
退火、延伸及检测荧光
60
30秒
4
仪器冷却
35
10秒
1
步骤3中60℃时荧光检测,检测通道:530nm (FAM)
4.3 样品设置
在仪器软件的相应样品设置窗口内填写各样品的名称、类型及工作标准品参数(见试剂盒内提示)。
【结果分析】
根据各类仪器的软件进行分析,得到各标本的HBV DNA检测结果。
(基线选取6~10或6~15个循环,阈值线选在阴性对照正常扩增曲线的上方)
【结果判断】
1.对于500≤测定拷贝数<108 拷贝/ml的样本,报告相应的测定结果。
2.对于测定拷贝数≥108拷贝/ml的样本,所测结果仅供参考,报告上注明≥108拷贝/ml。若需精确定量,可根据所测结果,将该标本用阴性血清稀释至105~106拷贝/ml后复测。
3.对于测定拷贝数<500拷贝/ml的样本,所测结果仅供参考,报告上注明<500 拷贝/ml或低于试剂盒检测下限。
4.对于HBV 扩增阴性的标本(Ct无数值),报告上注明<500 拷贝/ml或低于试剂盒检测下限。
【注意事项】
1.待检新鲜血清或血浆若不及时检测,应保存于-20℃。
2.试剂盒各组份使用前请充分融化并摇匀,离心管内的试剂需离心数秒后使用。
3.PCR操作各阶段应在不同实验区域进行,包括PCR扩增试剂准备区、标本处理区及PCR扩增检测区。
4.在标本处理阶段建议使用负压超净台。
5.应穿工作服,戴一次性手套(经常替换手套),使用一次性用品。
6.PCR操作人员应具有经验和受过培训。
7.操作过程中用到的超净台、移液器、离心机、扩增仪等仪器设备应经常用10%次氯酸或70%乙醇及紫外灯处理。
8.实验中废弃的吸嘴应弃于含10%次氯酸的废液缸中, 以防止污染。
9.阴性对照、工作标准品应和待检标本平行进行操作后方可进行PCR扩增。
10.使用本试剂盒检测,请按传染病实验室检查规程操作。
11.血清标本的测定结果比血浆标本测定结果略低。
实验三 丙型肝炎病毒核酸扩增(PCR)-荧光定量检测
【原理与用途】
本品从血清或血浆中提取HCV RNA,在逆转录酶作用下将RNA逆转录为HCV cDNA,在引物的指导下,以四种脱氧核苷酸为底物,通过耐热DNA聚合酶的酶促作用,对cD
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