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慢病毒介导RNAi沉默GTPBP4基因表达
慢病毒介导RNAi沉默GTPBP4基因表达 对结肠癌RKO细胞生物学行为的影响
摘 要
目的:根据GTPBP4基因序列设计并合成相应GTPBP4一siRNA,研究 GTPBP4.siRNA对人结肠癌RKO细胞生物学行为的影响。方法:上海吉 凯基因化学技术有限公司的GTPBP4基因RNA干扰慢病毒载体 LV-GTPBP4.RNAi及阴性病毒载体CON053,RNAi序列为 GCGTAGTCTTGGTGTTGACAT;培养RKO细胞,待细胞生长状态良好并 达到对数生长期时,于转染前一日接种于6孔板,设实验组、阴性对照组。 实验组加入慢病毒LV-GTPBP4.RNAi 5ul,滴度为2×108 TU/ml,阴性对 照组加入阴性病毒载体CON053 5ul,滴度为2×108 TU/ml。慢病毒感染 RKO细胞3天后,因慢病毒上携带报告基因GFP,故GFP的表达情况, 判断感染效率,待细胞长满培养板时收集细胞用于后续实验。①判断靶点 的干扰效果可用Real.time PCR法检测GTPBP4基因mRNA的表达情况: 慢病毒感染5天后,立即抽提实验组及对照组的RKO细胞的总RNA,并 逆转录合成cDNA,并经PCR反应扩增,采用2-6Act分析法分析Real.time PCR数值。②用western blot法检测GTPBP4蛋白质的表达情况:慢病 毒感染5天后,提取实验组及对照组RKO细胞的总蛋白,以BCA法来测 定蛋白浓度,以GAPDH蛋白为内对照进行SDS—PAGE电泳,免疫印迹(湿 转),抗体杂交,X光显影分析结果。③感染5天后,用Annexin V-APC 单染法流式细胞仪检测检测各组RKO细胞凋亡率。④用MTT法于分板后
万方数据
24
24 h、48 h、72 h、96 h、120 h 5个时间点检测各组RKO细胞的增殖情况。
⑤用PI.FACS细胞周期检测来检测GTPBP4基因与RKO细胞周期分布的 相关性。⑥通过感染后细胞在细胞培养板上的克隆形成能力来提示慢病毒 感染后细胞的成瘤能力。结果:①用荧光显微镜在慢病毒感染3天后观察, 根据发绿色荧光的RKO细胞所占比率判断慢病毒感染RKO细胞的效率达 80%以上。@Real.time PCR法检测结果:数值分析采用2-△△ct分析法,实 验组2-AACt平均值为0.208,对照组的2-AACt平均值为1.002,显示实验组RKO 细胞中GTPBP4的mRNA表达水平显著低于对照组p0.05)。@western
blot结果:x光显影后,可见各组内对照GAPDH蛋白灰度相似,而实验 组GTPBP4蛋白灰度值明显低于对照组,显示siRNA对目的基因的表达有 敲减作用,根据灰度分析结果,敲减效率达到72.9%。④凋亡检测显示: 慢病毒感染后,对于凋亡峰值实验组细胞明显高于对照组,且峰值出现时 间早于对照组,表明实验组RKO凋亡细胞增加。@MTT法检测结果:在 24 h、48 h、72 h、96 h、120 h 5个时间点对照组OD值均值分别为1.00、
1.54、2.6l、4.15、8.09,实验组分别为1.00、1.49、2.23、3.12、6.33,显 示慢病毒感染后,实验组RKO细胞MTT值比值(即增殖倍数)减小,提 示GTPBP4基因与RKO细胞的增殖能力显著相关。⑥PI—FACS细胞周期 检测结果:慢病毒感染后,处于G1期及G2/M期的实验组细胞显著增多, 而处于S期的明显减少,提示GTPBP4基因与RKO细胞的周期分布相关。
⑦细胞克隆形成检测结果:实验组细胞集落数目平均值为63,对照组为 106,显示慢病毒感染后,实验组RKO细胞集落数目与对照组细胞集落数 目相比减少,提示GTPBP4基因与RKO细胞的克隆形成能力相关。结论:
万方数据
1.慢病毒介导的RNAi能高效感染RKO细胞,并有效抑制RKO细胞中
1.慢病毒介导的RNAi能高效感染RKO细胞,并有效抑制RKO细胞中 相应基因的表达。2.沉默GTPBP4基因能抑制RKO细胞克隆形成能力及 增殖能力,同时诱导细胞凋亡,促进细胞周期阻滞。3.GTPBP4可能是结 肠癌新的治疗靶点。
关键词:GTPBP4基因;RKO细胞;RNAi;细胞生物学行为
万方数据
Lentivirus.mediated
Lentivirus.mediated RNA interference targeting GTPBP4 in human
colon cancer ceHs inhibits gene expression in biological behavior
Abstract:objective:According to the gene sequence of GTPBP4
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