山羊Agouti基因与毛色表型相关分析及其遗传变异的研究-动物遗传育种与繁殖专业毕业论文.docxVIP

摘要 摘要 本试验根据GenBank上已发表的牛(X99691)、猪(AJ427478)马(AF288358) 和人的Agouti基因序列设计引物，扩增山羊Agouti基因外显子l和内含子l的部 分序列片断，内含子1的部分序列与本实验室之前测得的山羊Agouti基因序列片 断(GenBank序列号：EF587236)进行拼接，得到5270bp长度的山羊Agouti基因 序列。比对分析我们得到的序列，又发现了2个SNPs，再对编码区外显子4的唯一 SNP位点进行分析，根据拼接结果命名这些突变位点，分别为399CT、128delT和 5701GT。其中，5701GT的突变引起了山羊Agouti信号蛋白125位上氨基酸的 改变(甘氨酸一缬氨酸)。本试验仅选取128delT和5701GT两个位点进行研究。 本研究利用PCR-RFLP技术对9个中国地方山羊品种，总共545个样品的山羊 Agouti基因5701GT位点进行研究。在5701GT位点上检测到2个等位基因，存 在3种基因型：TT、TG和GG。其中，T等位基因在被检测的大多数山羊品种中是优 势等位基因，再结合相应山羊品种的毛色表型进行相关性分析，我们推测，57016 T位点的T等位基因与山羊的黑色表型有关或者是该位点与控制山羊黑色表型的 位点存在连锁关系。遗传多样性分析指标表明，5701GT位点在中国黑色山羊品种 中的遗传多样性较低。群体遗传分化分析结果表明，9个地方山羊群体间的遗传分 化系数仅为0．2615。聚类分析也基本符合毛色表型的分类，并且在不同的群体中， 随着T等位基因频率的升高，其成年体重降低，这可能是由于Agouti基因外显子 4中的5701GT位点与山羊的生长速度有关。 本研究同样利用PCR-RFLP技术检测了128delT缺失突变位点在国内十个山羊 品种中的多态性并与毛色进行了相关性分析。结果表明，128delT缺失位点存在两 个等位基因A(缺失)和B(不缺失)，共产生三种基因型从、AB和BB，其中AB基 因型在白色山羊品种中占优势(76．14％)，从基因型在棕褐色山羊品种中频率较高 (78．69％)，BB基因型是黑色山羊品种的优势等位基因型(75．86％)，推测该位点可 能在山羊毛色形成过程中发挥一定作用。128delT缺失位点在被检测的10个山羊品 种的平均期望杂合度仅为0．4718，基因流为0．3190，遗传分化系数为0．4393，这 些都表明这10个山羊群体间遗传分化程度较低，遗传多样性相对贫乏。 关键词：山羊；Agouti；毛色；遗传多样性 Study Study on the Relationship between goat Agoua Gene and Color Phenotype and its Variation in Goat Populations Postgraduate：Tang Chunj．an Direction：Molecular Quantitative Genetics and Animal Breeding Tullo眠Li Xianglong Professor Abstract On the basis of sequences from GenBaak,part of l and intronl of goat Agoua gene fragments Wag amplified．The fragment of intront was joined with the fragment we had got before which had been handed out to GenBanL the Accession Number Wag EF587236．Two new point mutations we他 found in this fragment,and the only mutation in coding陀-gion of goat Agouti gene Wag analyzed again，80 we named these 3 mutations w讹named follow：399CT’128delT and 5701GT．And the mutation 5701GT lead to the amino acid substitution ofG(Gly)for V(、僦)at the position 125． A total of 545 individuals from nine Chinese indigenous goat breeds wele analyzed for 5701GT by PCR-RFLP in order to investigate its genet