桑树绿枝扦插高效生根的转录组测序分析及相关基因的验证特种经济动物饲养专业论文.docxVIP

江苏科技大学学位论文版权使用授权书 本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定， 同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版， 允许论文被查阅和借阅。本人授权江苏科技大学可以将本学位论文的 全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫 描等复制手段保存和汇编本学位论文。 本学位论文属于： (1)保密□，在 年解密后适用本授权书。 (2)不保密□。 学位论文作者签名： 指导教师签名： 年 月 日 年 月 摘 摘 要 江苏科技大学农学硕士学位论文 江苏科技大学农学硕士学位论文 I I PAGE PAGE VI 摘 要 桑树是蚕桑生产的物质基础，扦插是桑树繁殖的重要育苗方法，也是其它木 本植物经济有效的繁育方法。在人工诱导桑树扦插高效生根的基础之上，其机理 的研究角度由传统的形态学、解剖学、生理生化指标等逐步向分子水平深入。运 用转录组测序技术，有利于开展桑树扦插的生根机理的研究，为扦插技术的进一 步创新提供理论依据。 Solexa 测序是近年来发展迅速的一种高通量测序手段，相对传统测序技术其 具有覆盖度广、程度深、信息涵盖量大、数据冗余性低、分析准确以及不需要具 有基因组学背景即可分析新物种的转录本表达概况等优点。 本文用 Solexa 测序技术对桑品种育 71-1 绿枝扦插生根发育过程中插穗基部 皮层进行转录组测序及生物信息学分析，得到结果如下： 1. 三个样本转录组测序共产生了多于 230M 原始 reads 总量，经过格式转换、 去除杂质序列后得到的数据量分别为 88,216,727、88,616,727 和 52,756,096 个高 质量的 reads 数；经过组装后分别得到 61687、61651 和 59457 个片段（contigs） 数。 2. 对这些 contigs 进行 uniprot 蛋白注释，并进行 GO 和 KEGG 功能分类以 及 SSR 鉴定。蛋白注释结果为三个文库分别有 28042、32755 和 30587 个被注释 上，注释率为 45.46%、53.13%和 51.44%。 3. 通过不同样本间的数据两两比较发现桑树扦插生根发育过程中发生广泛 的基因表达调控变化，0 天与 4 天差异表达基因共 231 个，其中 148 个上调和 83 个下调；4 天与 8 天差异表达基因共 4183 个，其中 1831 个上调和 2352 个下调； 0 天与 8 天差异表达基因共 4557 个，其中 1930 个上调和 2627 个下调。 4. 对扦插生根发育过程中差异表达的基因进行 GO 和 KEGG 分析，发现一 些差异显著的途径，如糖酵解/糖异生，RNA 转运，植物激素信号转导和淀粉蔗 糖代谢等。还发现一些可能与桑树扦插生根相关的基因（如 lpi, HSP70, cTBP, CHS, ECPP44, M35 等）。 5. 通过实时荧光定量 PCR 技术对乙烯合成相关基因 aco 和 sams 的表达分 析，得出它们在常规扦插与人工诱导高效扦插生根插穗发育过程中表达模式差 异，得出基因 aco 和 sams 的表达与扦插高效生根呈现负相关性。 关键词 桑树；扦插；生根；转录组；差异表达基因；实时荧光定量 PCR Ab Abstract 江苏科技大学农学硕士学位论文 江苏科技大学农学硕士学位论文 III III PAGE PAGE IV Abstract Mulberry is the material basis of sericulture. Cuttage is one of the important seeding methods, as well as a economical-effective method for other woody plant’s. On the basis of the efficient artificially induced rooting, we transform the study angle from traditional cellular level, for example morphological, anatomical, physiological and biochemical indexes et al., to go deep into molecular level. We can comprehend the mechanism of mulberry softwood cuttings rooting more accurate by using the transcriptome sequencing technology, and of course it