第6讲 基因组和基因预测课件.pptx

第6讲 基因组学与基因预测;课堂内容;一、基因、基因组的概念;1、基因的概念;基因的由来;Theory of the gene;基因概念的进一步发展;基因重叠示意图;乙肝病毒的基因组;（2）内含子和外显子 人们在研究小鸡卵清蛋白基因时发现其转录形成的mRNA只有该基因长度的1/4，其原因是基因中一些间隔序列的转录物在RNA成熟过程中被切除了 这些间隔序列叫内含子，基因中另一些被转录形成RNA的序列叫外显子。小鸡的卵清蛋白基因中至少含7个内含子。因而从基因转录效果看，基因由外显子和内含子构成。;Ovalbumin DNA X cDNA;（3）管家基因和奢侈基因 管家基因 house-keeping gene; housekeeping gene 生物体各类细胞中都表达，对维持细胞存活和生长所必需的蛋白质编码的基因。如糖酵解和柠檬酸循环所需酶的编码基因等 奢侈基因 luxury gene 组织特异性基因 tissue-specific gene 特定类型细胞中为其执行特定功能蛋白质编码的基因;（4）基因的游动性 早在20世纪40年代美国遗传学家麦克林托克（B.McClintock）在玉米研究中发现“转座因子”，直至1980年夏皮罗（J.Shapiro）等人证实了可移位的遗传基因存在，说明某些基因具有游动性。为此，这位“玉米夫人”荣获了1983年度诺贝尔奖 ;DNA转座现象的一般遗传特点： ;基因组中不同的区域具有不同的功能 有些区域编码蛋白质的结构基因 有些区域复制及转录的调控信号 有些区域的功能尚不清楚;①从细胞遗传学的角度来看，基因组是指一个生物物种单倍体的所有染色体数目的总和； ②从经典遗传学的角度来看，基因组是一个生物物种的所有基因的总和； ③从分子遗传学的角度来看，基因组是一个生物物种所有的不同核酸分子的总和； ④从现代生物学的角度来看，基因组是指导一个生物物种的结构和功能的所有遗传信息的总和，包括全部的基因和调控元件等核酸分子。;基因组的大小：C值;基因组的大小和C值矛盾 某生物单倍体的DNA总量称C值，C值与生物的进化程度不完全对应。;;某些生物的基因组数据 物种 基因组大小 基因数目 基因长度 ΦX174 0.7kb 10 λ噬菌体 45Kb 100 大肠杆菌 4.2Mb 4200 1.2kb 酿酒酵母 13.5Mb 6300 1.4kb 果蝇 14 Mb 12000 11.3kb 人 3.3Gb 35000 16.3kb 拟南芥 70Gb 25000;二、典型生物的基因组特征;1、真核生物基因的特点;真核生物基因组DNA与蛋白质结合形成染色体，储存于细胞核内，除配子细胞外，体细胞内的基因的基因组是双份的（即双倍体，diploid），即有两份同源的基因组。 真核细胞基因转录产物为单顺反子。一个结构基因经过转录和翻译生成一个mRNA分子和一条多肽链。 存在重复序列，重复次数可达百万次以上。 基因组中不编码的区域多于编码区域。 大部分基因含有内含子，因此，基因是不连续的。 基因组远远大于原核生物的基因组，具有许多复制起点，而每个复制子的长度较小。;，内含子、启动子;2、 细菌基因组及其特点 a.细菌的“染色体”通常有一个环状或线型DNA分子组成，只有一个复制起点。不少细菌含有若干个小的环状DNA，被称作质粒(plasmid)。有些质粒可以从一个细菌转移到另一个细菌，不少经过改造的质粒在基因工程中被用作基因转移的载体。 b.编码蛋白质的基因为单拷贝的，但rRNA基因一般是多拷贝的。 c.基因组中有多种调控区，和少量重复序列，调控原件比病毒复杂，但比真核生物简单，重复序列比真核生物少得多。 d.功能相关的几个结构基因往往串联在一起，受它们上游的共同调控区控制，形成操纵子结构。 e.基因组中存在与真核生物类似的可移动DNA序列（转座子）。;26;DNA from a lysed E. coli cell. In this electron micrograph several small, circular