标准表格达载体的构建方法总结计划及步骤.docxVIP

标准表格达载体的构建方法总结计划及步骤.docx

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表达载体的构建方法及步骤 表达载体的构建方法及步骤 一、载体的选择及如何阅读质粒图谱 目前,载体主要有病毒和非病毒两大类 , 其中质粒 DNA 是一种新的非病毒转基 因载体。 一个合格质粒的组成要素: 1)复制起始位点 Ori 即控制复制起始的位点。原核生物 DNA 分子中只有一个复制起始点。而 真核生物 DNA 分子有多个复制起始位点。 ( 2)抗生素抗性基因可以便于加以检测,如 Amp+ ,Kan+ 3)多克隆位点 MCS 克隆携带外源基因片段 4) P/E 启动子 / 增强子 5) Terms 终止信号 6)加 poly (A )信号可以起到稳定 mRNA 作用 选择载体主要依据构建的目的, 同时要考虑载体中应有合适的限制酶切位点。 如果构建的目 的是要表达一个特定的基因,则要选择合适的表达载体。载体选择主要考虑下述 3 点: 【 1】构建 DNA 重组体的目的,克隆扩增 / 基因表达,选择合适的克隆载体 / 表达载体。 【 2】 .载体的类型: ( 1)克隆载体的克隆能力-据克隆片段大小 (大选大,小选小)。如10kb 选 第二步:再看筛选标记,如抗性,决定使用什么筛选标记。 1) Ampr 水解 β-内酰胺环,解除氨苄的毒性。 2) tetr 可以阻止四环素进入细胞。 3) camr 生成氯霉素羟乙酰基衍生物,使之失去毒性。 ( 4) neor (kanr )氨基糖苷磷酸转移酶使 G418 (长那霉素衍生物)失活 ( 5) hygr 使潮霉素 β失活。 第三步:看多克隆位点( MCS )。它具有多个限制酶的单一切点。便于外源基 因的插入。如果在这些酶切位点以外有外源基因的插入, 会导致某种标志基因的 失活,而便于筛选。决定能不能放目的基因以及如何放置目的基因。 第四步:再看外源 DNA 插入片段大小。质粒一般只能容纳小于 10Kb 的外源 DNA 片段。一般来说,外源 DNA 片段越长,越难插入,越不稳定,转化效 率越低。 第五步:是否含有表达系统元件, 即启动子-核糖体结合位点-克隆位点-转录 终止信号。这是用来区别克隆载体与表达载体。 克隆载体中加入一些与表达调控 有关的元件即成为表达载体。选用那种载体,还是要以实验目的为准绳。 第六步:启动子-核糖体结合位点-克隆位点-转录终止信号 1)启动子-促进 DNA 转录的 DNA 序列,这个 DNA 区域常在基因或操纵子编码序列的上游,是 DNA 分子上可以与 RNApol 特异性结合并使之开始转录的部位,但启动子本身不被转录。 2)增强子 / 沉默子-为真核基因组 (包括真核病毒基因组) 中的一种具有增强邻近基因转录过程的调控顺序。 其作用与增强子所在的位置或方向无关。 即在所调控基因上游或下游均可发挥作用。 / 沉默子-负增强子,负调控序列。 ( 3)核糖体结合位点 / 起始密码 /SD 序列( Rbs/AGU/SDs ): mRNA 有核 糖体的两个结合位点,对于原核而言是 AUG (起始密码)和 SD 序列。 4)转录终止序列(终止子) / 翻译终止密码子:结构基因的最后一个外显子中 有一个 AATAAA 的保守序列,此位点 down -stream 有一段 GT 或 T 富 丰区,这 2 部分共同构成 poly ( A )加尾信号。结构基因的最后一个外显子中 有一个 AATAAA 的保守序列,此位点 down - stream 有一段 GT 或 T 富 丰区,这 2 部分共同构成 poly ( A )加尾信号。 质粒图谱上有的箭头顺时针有的箭头逆时针,那其实是代表两条 DNA 链,即 质粒是环状双链 DNA ,它的启动子等在其中一条链上,而它的抗性基因在另一 条链上 . 根据表达宿主不同,构建时所选择的载体也会不同。 二、目的基因的获得 一般来说,目的基因的获得有三种途径: 调取基因:根据目的基因的序列,设计引物从含有目的基因的 cDNA 中通过 PCR 的方法调取目的基因, 链接到克隆载体挑取单克隆进行测序, 以获得想要的基因 片段,这种方法相对成本较低, 但是调取到的基因往往含有突变, 还有不同基因 的表达丰度不同, 转录本比较复杂, 或是基因片段很长, 这些情况都很难调取到 目的基因。 全基因合成:根据目的基因的 DNA 序列,直接设计合成目的基因。此方法准确 性高,相对成本会高一些,个人操作比较困难,需要专业的合成公司完成。优点 是可以合成难调取及人工改造的任何基因序列, 同时可以进行密码子优化, 提高 目的基因在宿主内的表达量。 三、克隆构建 目前,克隆构建的方法多种多样, 除了应用广泛的酶切链接以外, 现在还有很多 不依赖酶切位点的克隆构建方式。下面具体说一下双酶切方法构建载体的步骤

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