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第四章 DNA的生物合成;第二节 DNA复制的反应体系;核苷酸与核苷酸之间生成磷酸二酯键是复制的基本化学反应;一、DNA聚合酶;;(一)原核生物有3种DNA聚合酶;2个核心酶
1个?-复合物(?、?、??、?、?、? 6种亚基)
1对?-亚基(可滑动的DNA夹子);DNA-pol Ⅰ(109kD);323个氨基酸; “在老孔伯格获奖十年之后,人们才知道,他所发现的DNA聚合酶并非细菌真正用于复制DNA的酶,在细胞内执行这个任务的是另一种新发现的酶——DNA聚合酶III。老孔伯格的酶(被命名为DNA聚合酶I)只是在DNA复制中起修补作用(不过,这种酶后来在分子生物学研究和遗传工程中发挥了巨大的作用)。值得老孔伯格欣慰的是,新的酶是他的二儿子托马斯·孔伯格在哥伦比亚大学读书时发现的。托马斯现在是加州大学旧金山分校的生物化学教授。 ”(方舟子博客:上阵父子兵)
这一家人共发现了30多种酶。 老孔伯格1975年写了一本书 “For the love of enzymes” (酶的情人);DNA-polⅠ的主要功能:
去除引物,填补引物消除后的空隙;
对复制中的错误进行校读,填补修复中出现的空隙。;DNA-pol Ⅱ(120kD);(二)常见的真核细胞DNA聚合酶有5种;增殖细胞核抗原(proliferation cell nuclear antigen,PCNA)在复制起始和延长中起关键作用。PCNA为同源三聚体,具有与E.coli DNA 聚合酶Ⅲ的β亚基相同的功能和相似的构象,即形成闭合环形的可滑动DNA夹子,在RFC的作用下PCNA结合于引物-模板链;并且PCNA使polδ获得持续合成能力。PCNA水平也是检验细胞增殖的重要指标。;DNA聚合酶共同特点;DNA聚合酶对碱基的识别及选择
和校对功能实现复制的保真性;;1. 解螺旋酶(helicase);;拓扑异构酶Ⅰ;3. 单链DNA结合蛋白(single stranded DNA binding protein, SSB);引物(primer);四、DNA连接酶(DNA ligase);DNA连接酶(DNA ligase);;小结:DNA复制的反应体系;第三节 DNA复制过程
The Process of DNA Replication in;E. Coli 基因图;E.coli复制起始点 oriC;;;;;;领头链的合成:;; 在复制叉同时合成前导链和后随链;;复制过程简图;切除引物
5′→3 ′外切酶活性;;为什么一定要引物?;;多个复制起始点,冈崎片段短,复制叉前进速度慢
复制子(replicon):两个复制起始点之间构成
DNA复??与核小体装配同步进行;Pol ?/引发酶 合成RNA-DNA引物
Pol ? 合成前导链和后随链
RFC 识别引物iDNA的3?端并驱除Pol ?/引发酶
PCNA 结合DNA并引入Pol ?
RNAse H I/FEN1 切除冈崎片段5?端的RNA引物
Pol ?(或Pol ?) 填补冈崎片段之间的空隙
DNA连接酶Ⅰ 封口
RPA 稳定解旋后的单链DNA
解旋酶 复制叉的形成和移动必不可少
拓扑异构酶 释放复制叉前进时产生的扭曲应力;Comparison of Prokaryotic and Eukaryotic DNA Polymerases;;前导链产生完整的子染色单体。
后随链3?端留下缩短的未复制的ssDNA区。;;端粒(telomere);端粒酶(telomerase)是一种核糖核蛋白(RNP),由RNA和蛋白质组成。
端粒酶RNA (human telomerase RNA, hTR)
端粒酶协同蛋白(human telomerase associated protein 1, hTP1)
端粒酶逆转录酶(human telomerase reverse transcriptase, hTRT)
功能:
端粒酶以自己的RNA组分作为模板,以染色体的3?端ssDNA(后随链模板)为引物,将端粒序列添加于染色体的3?端。这些新合成的DNA为单链。;端粒酶催化作用的爬行模型 ;DNA聚合酶复制子链;端 粒;端粒酶与细胞寿命;基因突变(gene mutation);一、引发突变的因素;化学因素;突变的意义;二、基因突变类型;谷 酪 蛋 丝;
光复活修复:400nm左右的光激活光复活酶,专一分解紫外光照射引
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