基于网络药理学探究1-脱氧野尻霉素治疗2型糖尿病作用机制.docxVIP

基于网络药理学探究1-脱氧野尻霉素治疗2型糖尿病作用机制 摘要：目的 运用网络药理学探讨1-脱氧野尻霉素（DNJ）治疗2型糖尿病（T2DM）的潜在作用机制。方法 在SwissTargetPrediction网站检索获取DNJ的潜在靶点，应用GeneCards、OMIM数据库筛选T2DM相关靶点；使用STRING11.0数据库结合Cytoscape 3.7.2软件构建靶点相互作用（PPI）网络并进行可视化，同时使用Cytoscape 3.7.2软件的Cytohubba和MCODE插件挖掘DNJ作用于T2DM的PPI网络核心靶点，最后利用Metascape数据库进行基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析。结果 获得DNJ与T2DM共同靶点72个，核心靶点包括MGAM、CNR1、GLA、GLB1、SI、MANBA和DRD2;GO和KEGG富集分析发现DNJ主要涉及化学突触传递、顺行突触信号、碳水化合物代谢过程等生物学过程，通过调节神经活性配体-受体相互作用、cAMP信号通路、半乳糖代谢、淀粉和蔗糖代谢等发挥T2DM治疗作用。结论 DNJ可能通过多靶点、多通路发挥T2DM治疗作用。 糖尿病是一组因胰岛素绝对或相对分泌不足和（或）胰岛素利用障碍引起的碳水化合物、蛋白质、脂肪代谢紊乱性疾病。根据国际糖尿病联合会2019年最新报告，到2045年，糖尿病患者将从2019年的4.63亿增加到7亿，其中，90%左右为2型糖尿病（type 2 diabetes mellitus,T2DM)中药及其提取物在内的天然活性产物，以其资源丰富、作用温和、毒副作用小而被用于治疗T2DM，逐渐成为研究热点1 资料与方法1.1 数据库Pub Chem数据库（/）；Swiss Target Prediction网站（http://www.swisstargetprediction.ch/）；Genecard数据库（/）；OMIM数据库（/）；Draw Venn Diagram网站（http://bioin formatics.psb.ugent.be/Webtools/venn/）；STRING11.0数据库（/）；Metascape数据库（）。1.2 DNJ潜在靶点获取利用DNJ的CAS号（19130-96-2）从Pub Chem数据库（/）获得DNJ的SDF文件，将SDF文件导入Swiss Target Prediction网站1.3 T2DM相关靶点收集以“2型糖尿病（type 2diabetes mellitus,T2DM）”为关键词输入到Genecard数据库1.4 药物与疾病共同靶点筛选及互作网络构建使用Draw Venn Diagram(http://bioinformatics.psb.ugent.be/Webtools/venn/）对T2DM治疗靶点和DNJ潜在靶点进行分析，获取药物与疾病的共同靶点，绘制韦恩图（Venn），这些共同靶点代表DNJ治疗T2DM的潜在作用靶点。利用STRING11.0数据库1.5 核心靶点分析使用Cytoscape 3.7.2软件的插件Cytohubba和MCODE挖掘DNJ作用于T2DM的PPI网络核心靶点1.6 GO和KEGG富集分析利用Metascape数据库2 结果2.1 DNJ和T2DM潜在靶点获取利用Swiss Target Prediction网站对DNJ进行靶点预测，共获得100个潜在靶点（见图1A）。通过Genecard数据库与OMIM数据库检索，去除重复值，共获得T2DM疾病相关靶点5381个（见图1B）。2.2 共同靶点PPI网络构建绘制Venn图，结果表明，通过匹配100个药物靶点和5381个疾病靶点，筛选出72个共同靶点（见图2A），即DNJ治疗T2DM的潜在靶点。基于STRING11.0数据库得到共同靶点的PPI网络，互作网络中有71个节点（剔除一个游离节点）和245条边，节点代表DNJ与T2DM的共同靶点，边代表靶点间的互作关系。其中，节点越大，颜色越深，该节点与其他节点的连接数量越多，表示该节点在整个网络中的贡献度（degree）越大，即该靶点与其他靶点互作频次高，说明药物与其有较高的结合活性，PPI网络图中重要靶点包括PT-GS2、MGAM、CNR1、GLA、GLB1、SI、MANBA和DRD2等（见图2B）。2.3 核心靶点分析结果Cytohubba分析获得MGAM、CNR1、GLA、GLB1、SI、MANBA和DRD2共7个核心靶点（见图3A）。MCODE分析获得了得分最高的两个模块，得分分别为7.067和4.000。模块1和模块2包含了从Cytohubba分析中获得