虚拟筛选技术及其应用.pptVIP

ZINDENV NS2B-NS3pro的相互作用 筛选出小分子ZINZINDENV NS2B-NS3pro的作用：红色代表疏水键，蓝色代表氢键 八个疏水键，三个氢键 * This project demonstrated the successful application of a powerful drug discovery portal to identify leads for further development. The portal provides access to the supercomputer resources of the Texas Advanced Computing Center to rapidly screen several integrated libraries containing almost a million druglike ligands. This project demonstrated the successful application of a powerful drug discovery portal to identify leads for further development. The portal provides access to the supercomputer resources of the Texas Advanced Computing Center to rapidly screen several integrated libraries containing almost a million druglike ligands. libraries are available for immediate purchase from established chemical companies, which facilitates rapid validation of highscoring hits from virtual screening experiments. concluding remarks * 4. 虚拟筛选可以应用于食品保鲜剂的开发 食品常见保鲜剂中，除了乳链球菌素（Nisin）和溶菌酶的作用机理比较明确外，其它保鲜剂的作用机理不明确，易造成应用上的混乱。它们可能是作用于同一靶点，重复添加可能会在分子或者细胞水平多细胞造成损伤。另外，大多数保鲜剂不是针对微生物的特有结构来发挥活性，很多是通过破坏细胞膜而发挥作用，而人的细胞膜具有相似的结构，同样会被破坏。 针对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌依次进行大规模虚拟筛选，得到多靶点的抑制剂。 得到既可以抑制革兰氏阳性菌，又可以抑制革兰氏阴性菌的保鲜剂。 用于生产中，可以取代其它功能单一的添加剂，从而减少食品中添加剂的种类和用量。 * Thank you! * 虚拟筛选技术及其应用 * 内容简介 1.虚拟筛选技术的介绍 2.重点介绍基于靶点结构的虚拟筛选——分子对接 3.虚拟筛选在药物研发中的应用实例 4.虚拟筛选与新型食品保鲜剂的开发 * 1.1 虚拟筛选技术产生的背景 20世纪80年代中期，随着分子生物学和结构生物学的发展，靶标生物大分子的功能被阐明、三维结构被测定。以及计算机科学的发展，功能先进的图形工作站的出现，分子对接(molecular docking)方法和数据库搜寻方法已经出现，并发展了第一个分子对接程序DOCK。 20世纪90年代中期， 基于小分子的药物设计(LBDD)方法和基于受体生物大分子结构的药物设计(SBDD)方法，已成为创新药物研究的核心技术之一。同时由于超级计算机技术的发展，产生了虚拟筛选并行算法，实现了虚拟筛选的高通量化。 近年来，PC集群式计算机(cluster)的普及，进一步促了进虚拟筛选技术的发展。 * 化学信息学：利用计算机技术对化学分子结构和相关信息进行管理的学科，可促进化学信息的获取、转化与共享。例如：将小分子化合物的一维、二维、三维结构以一些格式文件形式储存，并生成数据库。