林麝源铜绿假单胞菌噬菌体vB_PaeM_PAMD02_的生物学特性与全基因组序列分析.docxVIP

微生物学通报 Microbiology China /wswxtbcn Jul. 20, 2023, 50(7): 3020?3034 DOI: 10.13344/j.microbiol.china.220979 Copyright ?2023 Microbiology China All Rights Reserved 研究报告 研究报告 林麝源铜绿假单胞菌噬菌体 vB_PaeM_PAMD02 的 生物学特性与全基因组序列分析 李依濛 1， 刘洁 1， 焦升镜 1， 伍茜 1， 丁慧 1， 付文龙 2， 周磊 2， 程建国 2， 吴杰 2， 罗燕*1 1 四川农业大学动物医学院，四川 成都 611130 2 四川养麝研究所， 四川 都江堰 611830 李依 李依濛, 刘洁, 焦升镜, 伍茜, 丁慧, 付文龙, 周磊, 程建国, 吴杰, 罗燕. 林麝源铜绿假单胞菌噬菌体 vB_PaeM_PAMD02 的 生物学特性与全基因组序列分析[J]. 微生物学通报, 2023, 50(7): 3020-3034. LI Yimeng, LIU Jie, JIAO Shengjing, WU Xi, DING Hui, FU Wenlong, ZHOU Lei, CHENG Jianguo, WU Jie, LUO Yan. Biological characterization, and whole genome sequencing of bacteriophage against Pseudomonas aeruginosa isolated from forest musk deer (Moschus berezovskii)[J]. Microbiology China, 2023, 50(7): 3020-3034. 摘 要： 【背景】圈养林麝一半以上的死亡是由铜绿假单胞菌引起的化脓性疾病导致。另外， 由 于细菌的抗性增加，噬菌体是继抗生素后的另一抗菌选择。【目的】以分离自病死林麝肺脏的铜 绿假单胞菌为宿主菌分离一株噬菌体， 对其进行生物学特性、全基因组序列分析与体内抑菌试验。 【方法】通过双层平板法分离纯化一株裂解性噬菌体，测定其裂解谱、最佳感染复数、 一步生长 曲线、热稳定性、最适生长 pH 等生物学特性， 通过电镜观察其具体形态， 进行全基因组测序与序 列分析，并进行小鼠体内抑菌试验。【结果】分离到一株裂解性铜绿假单胞菌噬菌体并命名为 vB_PaeM_PAMD02， 该噬菌体具有透明且边缘清晰无晕环的噬菌斑， 其裂解谱较窄， 最佳感染复 数为 0.1， 裂解潜伏期为 40 min， 裂解暴发量较高， 热稳定性较高， 可耐受弱碱环境。其全基因组 大小为 66 264 bp，GC 含量为 55.59%，序列注释结果显示该噬菌体具有 92 个开放阅读框， 不含毒 力与耐药基因， 属于肌尾噬菌体科。小鼠体内抑菌试验结果显示了 PAMD02 对其宿主菌良好的抑 菌效果。 【结论】本研究分离的噬菌体 PAMD02 有较高的裂解效率， 对不利环境有较好的耐受性， 不含毒力基因与耐药基因，具有应用于临床治疗铜绿假单胞菌感染的潜力。 关键词： 噬菌体；铜绿假单胞菌；生物学特性；全基因组序列分析；林麝 资助项目：四川省科技厅省级科研院所科技成果转化项目(2022JDZH0026) This work was supported by the Science and Technology Achievements Transfer Project from Scientific Research Institutions of Sichuan Provincial Science and Technology Department (2022JDZH0026). *Corresponding author. E-mail: lycjg@163.com Received: 2022-10-08; Accepted: 2023-01-03; Published online: 2023-02-22 李依濛等: 林麝源铜绿假单胞菌噬菌体 vB_PaeM_PAMD02 的生物学特性与全基因组序列分析 3021 Biological characterization, and whole genome sequencing of bacteriophage against Pseudomonas aeruginosa isolated from forest musk deer (Moschus berezovskii) LI Y