遗传性肾病的基因诊断与案例分析.pptxVIP

遗传性肾病的基因诊断与案例分析1 内容提要遗传病概述二代测序技术简介遗传性肾病基因检测应用 遗传病概述 细胞、染色体和基因4 核基因：32亿个碱基对（3G）2.6万个基因外显子区占总长度的1.5%最大染色体250Mb最小染色体3.8Mb线粒体：16.6kb37个基因人类基因组3 外伤遗传因素和环境因素在疾病中的作用单基因疾病多因子疾病致病基因易感基因健康 / 疾病 = 基因 + 环境因素遗传因素环境血友病 大肠癌 老年痴呆 中风 心血管疾病 肺癌 交通意外 地贫 乳腺癌 糖尿病 皮肤癌 外伤 哮喘 遗传突变7 -CCT GAG GAG- -Pro Glu Glu- -CCT GTG GAG- -Pro Val Glu-唐氏综合征 镰刀状红细胞贫血 8单基因病：单个基因突变，如成人多囊肾染色体病：染色体畸变，如唐氏综合征线粒体遗传病：线粒体基因组突变，如线粒体耳聋多基因病：多个基因协同突变，如家族性高血压、糖尿病体细胞突变：如肺癌遗传病分类 单基因病-孟德尔遗传病-单基因遗传病9定义：某种疾病的发生主要受一对等位基因控制，它们的传递方式遵循孟德尔分离定律。 遗传方式常显X连锁 1次采血 1次检测终生不变 红细胞白细胞血小板抗体游离DNA片段微生物凝血因子…1. 每个细胞都有一 个完整的基因组2. 这些基因组DNA绝大 多数都是均质的血DNA检测 二代测序技术简介 第二代测序： Illumina Genome Analyzer测序技术~1000 molecules per ~ 1 μm cluster ~1000 clusters per 100 μm square~40 million clusters per experiment打断的DNA片段接头连接结合至Flowcell，扩增成簇20 microns测序 边合成边测序（Sequencing-by-Synthesis，SBS)5’GTCAGTCAGTCAGT3’5’CAGTCATCACCTAGCGTA 加入第一个碱基Cycle 1: 加入测序试剂 去掉未加入的碱基 信号检测Cycle 2-n: 加入测序试剂，重复。 123789456T T T T T T T G T …T G C T A C G A T …贯序成像并记录信号，读取碱基序列Base calling 16ACADVL:c.68delG(p.Arg28ArgfsX38) 低深度高深度覆盖度高通量测序的两个重要参数14 受检者受检者PKD1基因测序质量图15 目标序列捕获捕获定义：有目的地富集，传统的PCR可认为一种捕获。捕获原理：大规模合成与目的基因互补的短序列，即为探针。 目标基因频率0.05烈性突变错义及框内移码突变文献家系分析生成报告预测有害预测无害深度内含子CNV全部基因频率0.05烈性突变错义及框内移码突变家系分析生成报告预测无害预测有害文献CNV若有若有若有若无若无若无①标准分析②深度分析解读流程 遗传性肾病基因检测应用 遗传性肾病特点22家族遗传史；多系统受累，常有肾外表现；预后差，难以治愈；不易确诊；肾病可在不同阶段使全身多系统受累 辅助诊断指导治疗风险评估遗传咨询确定致病突变，精确诊断对患者指导治疗方案对无临床症状者，了解基因携带情况评估患病的风险，采取必要措施降低发病风险为患者家庭提供生育指导，防止有害突变传递遗传性肾病基因检测的临床意义23 遗传性肾病V2芯片所包含的基因个数遗传性肾病已知候选基因panel疾病大类疾病V1（个）V2（个）增加数目肾小球病Alport综合征…32364纤毛病Joubert综合症，肾髓质囊性病…64728补体相关补体因子缺陷01313肾小管和间质病Dent病，肾小管酸中毒…40466综合征类Beckwith-Wiedemann综合征…1021119其他未归类577212肾石病高草酸尿症，遗传性肾结石…17170多囊肾多囊肾330先天性尿路畸形CAKUT20200错构瘤Wilms瘤等20200合 案例分析1郝XX，28岁，G3P0，2015年B超胎儿异常引产，现查明原因1. 双肾回声稍有增强，皮质和髓质 分界显示欠清。2. 建议做染色体芯片+基因芯片检测25 1. 染色体分析结果为阴性。高通量捕获测序检测多囊肾的 panel