adfcofilin家族的生物信息学分析.docxVIP

adfcofilin家族的生物信息学分析 细胞骨架中的肌动蛋白参与了许多重要的生理活动，如肌肉收缩、细胞环流、细胞运动、细胞分离等。这些过程的发生除了需要肌动蛋白以外,还需要一些与之结合的调节蛋白参与,现在已经发现了100多种肌动蛋白结合蛋白,其中有一类分子量为15-20KD的蛋白,如肌动蛋白解聚因子(actin depolymerizing factor,ADF)、cofilin、profilin、actophorin、depactin、destrin、UNC-60等,在一定条件下可以使肌动蛋白微丝解聚,统称为ADF/cofilin分子家族。 一、 adf在生物细胞和细胞内不同组织分布及分布特点 ADF/cofilin分子家族在哺乳类、鸟类、两栖类、昆虫、棘皮动物、原生动物和植物等生物的细胞内广泛存在,其中cofilin广泛分布于从酵母到哺乳类的生物体内,而destrin主要集中分布在鸟类和哺乳类的个体中。 ADF/cofilin分子家族的存在是与其功能密切相关的,每一种分子根据其功能的需要,在个体的不同组织、细胞以及细胞内部不同部位的分布都有一定程度的差异。ADF位于许多脊椎动物组织中,在神经元细胞中尤为丰富。在百合和油菜的花丝中检测到特异表达的ADF(分别称为LMP131A和BMP1),而在花瓣、心皮、花芽、叶片和根中则检测不到。变形虫中的actophorin与肌动蛋白一起主要分布于胞质皮层中,特别是在运动细胞的前缘。 ADF/cofilin分子家族在生物个体的不同发育阶段,其分布和含量也有一定的差异。鸟类的ADF,亦存在于鸡胚和绝大多数成熟组织中,占总蛋白的0.1%-0.4%,而成熟心脏和骨骼肌中含量不到0.02%,当受精卵发育到11天时,骨骼肌中ADF的量达到最大值,孵出14天后降低到成年水平。玉米中的ADF分子ZmABP1和ZmABP2在花粉粒和萌发的花粉管中特异表达,而ZmABP3在这个时期检测不到,可能在这一特定的发育阶段,ZmABP1和ZmABP2受到某种信号的调节而表达。但在大鼠小脑的整个发育过程中,ADF的量始终保持恒定,且主要位于Purkinje细胞中。 二、 adfcofili分子家族对肌肉和蛋白岩的影响 1. adf与g-actin的结合 ADF/cofilin分子家族在一定条件下可以与G-actin、F-actin相结合,形成1:1的ADF-actin复合物,但对结合了ATP、ADP、AMPPNP等核苷酸的G-actin和F-actin的亲和力不同。其中人的ADF与G-actin结合形成的复合物的解离常数为0.2μmol/L,源于鸡胚脑细胞中的ADF在体外与G-actin-ATP和G-actinAMPPNP结合形成的复合物的解离常数是0.1-0.2μmol/L,而与G-actin-ADP结合形成的复合物的解离常数为1.3μmol/L。在生理离子条件和pH7.8时,拟南芥ADF1结合G-actin-ADP或F-actin的量是ATP或ADP-Pi结合形式的两倍,表明ADF能够优先与actinADP相结合。变形虫的actophorin与变形虫和兔骨骼肌的G-actin的亲和力相同,但对兔F-actin的亲和力是对变形虫F-actin的亲和力的10倍。1997年Jiang等用玉米ZmADF3的两个突变体进行实验,ZmADF3-1为分别用Phe和Gly替换ADF3中Tyr103和Ala104的突变体,结果与G-actin和F-actin的结合能力均减弱;ZmADF3-2为用Phe替换ADF3中Tyr67和Tyr70的突变体,结果对G-actin的亲和力与ADF3相似,但不与F-actin相结合,表明ADF与G-actin和F-actin的结合部位不同。 在一定条件下,ADF/cofilin可以促使肌动蛋白微丝解聚。例如人的ADF、鸟的ADF、cofilin、猪的destrin、变形虫的actophorin以及棘皮动物的depactin等在较高的pH值条件下,都可以促使微丝解聚。但是,不同来源的ADF/cofilin和肌动蛋白之间的作用也不相同。如尽管秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegan)的肌动蛋白和兔骨骼肌的肌动蛋白的生化特性相同,UNC-60对C.elegan的微丝具有明显的解聚活性,而对兔骨骼肌的微丝无明显作用有人认为ADF/cofilin是通过隔离肌动蛋白单体促使微丝解聚的,Charlier等则认为是通过改变G-actin的临界浓度来实现的,而McGough等的研究证明cofilin可能是通过增加微丝之间的扭曲程度,从而促使微丝解聚的,这方面的机理还有待进一步的深入探讨。另外值得一提的是,ADF/cofilin不只具有结合肌动蛋白和解聚微丝的活性,改变条件,它们也能促使微丝聚合