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骨伤感染患者的多重细菌检测、临床特征和阴沟肠杆菌
复合菌基因分析
摘要
研究目的
骨伤科感染的病原学对于正确和及时的临床治疗非常重要,但目前研究较少。
本文以骨伤科感染住院患者为研究对象,快速检测和定量重要细菌病原体,建立感
染谱,探索其临床特征及危险因素;分析骨科感染流行病学及细菌生物信息学特点,
旨在为确立骨伤科感染的病原谱、解析病原特异性临床特征和优化诊疗方案提供一
定的依据。
研究方法
本研究纳入2020年11月21日至2023年11月04日期间青岛市黄岛中医医院
骨伤科住院患者400例,根据患者入院诊断的临床症状将患者分为疑似感染组
(n=229)和非感染组(n171),对两组的基础信息和临床特征进行分析比较。收集
患者伤口或渗出液拭子样本,采用自主建立和验证的多重荧光定量聚合酶链反应
(Multiplexreal-timequantitativepolymerasechainreaction,qPCR)体系,对所有患
者样本直接进行12种细菌的快速检测。结合细菌培养结果,分析和比较疑似感染患
者的病原检出率和载量关系,进而确定与感染相关的致病菌种类,病原特征性临床
特征及骨伤感染的风险因素。对阴沟肠杆菌复合体菌株进行全基因组测序,鉴定菌
种并构建系统发育树,分析其遗传学特征。
研究结果
1.患者流行病学特征:骨伤科住院患者男性有279人(69.8%),女性有121人
(30.3%);患者平均年龄为50.5岁,年龄分布在15-64岁的患者占77.5%;骨伤科
住院患者入院诊断归为三类,包括因术后再次住院(49,12.2%)、开放性损伤(176,
44.0%)和闭合性损伤(175,43.8%),疑似感染组和非感染组各以开放性损伤和闭
合性损伤为主(P0.001)。
疑似感染组中,白细胞计数偏高的患者占18.1%(41/227),淋巴细胞百分率偏
高的患者占6.6%(15/227),单核细胞百分率偏高的患者占20.2%(46/227),中性粒
细胞百分率偏高的患者占23.3%(53/227),C-反应蛋白偏高的患者占62.1%(82/132),
红细胞沉降率偏高的患者占70.8%(75/106),D-二聚体偏高的患者占29.9%(56/187),
降钙素原偏高的患者占51.4%(37/72),但是均未显著高于非感染组的占比。
2.病原检测结果:有20.5%的患者(82/400)细菌培养阳性,检出率在疑似感染
组(78人)和非感染组(4人)间有统计学差异(P0.001)。疑似感染组中,金黄色
葡萄球菌(Staphylococcusaureus)的检出率为21.8%、铜绿假单胞菌(Pseudomonas
aeruginosa)为3.1%、肺炎克雷伯菌(Klebsiellapneumonia)为3.1%以及鲍曼不动
杆菌复合菌(Acinetobacterbaumanniicomplex,ABC)为2.6%。qPCR检测中,有25.5%
的患者(102/400)至少检出一种病原的患者,疑似感染组有90人(39.3%,90/229),
非感染组有12人(7.0%,12/171,P0.001)。培养法和多重qPCR法检测结果一致
性中等(Kappa=0.712,P0.001),疑似感染组中,病原检出率S.aureus为26.6%,
K.pneumonia为8.7%,大肠埃希菌(Escherichiacoli)为6.6%,E.cloacae为4.8%,
A.baumannii为3.5%,这5种病原检出率均高于非感染组(P0.05)。定量分析显示,
疑似感染组总体PCR阳性截断值(quantificationcycle,Cq)29.5(26.0,32.4)(中位
数,四分位数间距)显著低于非感染组33.8(28.9,34.6),(P=0.045)。
3.疑似感染组病原相关的临床特征及实验室检查结果:12种病原检出的患者中
男性占75.7%(78/103),平均年龄52岁,与无病原组无差异(P0.05)。临床
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