高通量基因表达谱的应用.pdfVIP

、)lnⅣw．chinadairy．net 中国乳品工业 zgrpgy@163．com dqjryINDUSTRY 高通量基因表达谱的应用 胡红柳 ，侯晓明，曲波，高学军，李庆章 (东北农业 大学 乳 品科 学教 育部重 点 实验 室 ，哈 尔滨 150030) 摘 要 ：基 因表达谱可以描绘特定情况下组织、细胞 中所表达的全套基因及其丰度 ，它从mRNA水平上反映出组织或细胞特异性表型 和表达模式。目前基于高通量的基因表达谱主要有基因芯片和数字基 因表达谱 (DGE)。本文主要介绍了基因芯片和DGE的原理、特点， 并对其在作物科学、动物科学和乳品科学中的应用做了简要列举。 关键词：基 因表达谱 ；高通量 ；基 因芯片；数字基 因表达谱 中图分类号：Q343 文献标识码 ：B 文章编号 ：1001—2230(2012)12—0040—04 Application ofhighthroughputgeneexpressionprofiling HU Hong—hu，HoUXiao—uring，QU Bo，GAOXue-jun，LIQing—zhang (KeyLaboratoryofDairyScienceofEducationMinistry，NortheastAgriculturalUniversity，Harbin150030，China) Abstract：Geneexpressionprofilnigcandescribetheglobalgenomeaswellasgeneabundanceoforganizationandcellsincertaincases，which revealsorganizationorcellsspecificphenotypeandexpressionpatternsatthemRJNA leve1．Currentlythepfima~ high throughputgeneex- pressionprofilnignidudeDNAmicroarrayanddigitalgeneexpressionprofliing (DGE)．Thispaperm focusesontheprinciplealongwith characteristicofgeneexpressionprofliingchipandDGE，na dsummarizesbrieflyhteapplication incropscience，animal scienceandveterinary SCiericeforbodl0fthem ． Keywords：geneexpressionprofiling；hi曲htroughput；DNAmicroarray；ditalgeneexpressionprofiling DNA 芯 片 (DNA chip)、DNA微 芯 片 (DNA mi— 0 引 言 crochip)、DNA微 阵 列 (DNA microarray)、DNA阵 列 基 因表 达 谱 (geneexpressionprofile)可 以描 绘 特 (DNA a=ay)、寡 核 苷 酸微 芯 片 (o1igonuc1eotidemi— 定情况 下组 织 、细 胞 中所 表达 的全套 基 因及 其 丰度 ， crochip)．其 按 照用 途 可 分 为 测 序 芯 片 、表 达谱 芯 片 、 又 称 转 录 组 (transcriptome)．它从 r NA水 平 上 反 映 诊 断 芯片 、指纹 图谱芯 片 、毒理 芯片 等 。在基 因芯片 中 出组织 或细 胞特 异性 表型 和表达 模式 通 过对 基 因表 又数基 因表 达谱 芯 片应用 最广 泛 ，技 术也 最成 熟 。 达 谱 的生 物信 息学 搜索 、查 询 、比较 和分 析 ，可从 中获 1．1 基 因芯 片 的原 理 取 基 因转 录 、基 因调