扩增片段长度多态性在蔷薇基因组DNA检测中的应用.pdfVIP

西 南 农 业 学 报 2008年21卷 6期 1698 SouthwestChinaJournalofngncultural Sciences Vo1．2l No．6 文章编号：1001—4829(2008)06—1698—04 扩增片段长度多态性在蔷薇基因组 DNA检测中的应用 苟本富 (重庆文理学院生命科学系，重庆 永川 402160) 摘 要：采用单酶切和双酶切AFLP技术分别对5种不同蔷薇品种基因组DNA的遗传多态性进行了检测，比较了2种方法的多态 性比率。单酶切采用10条人工设计的与接头序列相识别的AFIP选择性引物，用 ￡I酶切，共获得 108个AFLP标记，片段大小 在 100～2000bp，得到33个多态位点，多态性位点百分率为3O．56％；双酶切采用25对双酶切AFLP I物，在50～600bp扩增出 清晰条带658条，得到 182个多态位点，占总扩增带的27．6％。对多态性片段进行统计，计算出不同品种间的相似系数和遗传距 离。结果表明：硕苞蔷薇同其它4种蔷薇的遗传距离偏远，且其它四种蔷薇的遗传距离均较近，这与蔷薇品种来源和培育史相符。该研究 表明两种AFLP标记均可用于蔷薇品种基因组DNA的遗传多态性的检测，准确评价尚待和其它品种对比研究后确定。 关键词：蔷薇；基因组DNA；遗传多态性；遗传相似系数；AFLP 中图分类号：$685．12 文献标识码 ：A ApplicationofAFLP in thegenomicDNA detection ofrose G0U Ben．fu (CollegeofLifeScience，ChongqingUniversityofArtsandSciences，ChongqingYongchuan402160，China) Abstract：Itwastodetectthegeneticpolymorphism offivedifferentrosevarieties’genomicDNA byadoptingtheAFLPtechniqueofsingle ordoubleenzymedigestionrespectivelyandcomparethepolymorphieratioofthetwomethods．Inthesinglesenzymedigestion，10human—de- signedA兀 selectiveprmers differentfromadaptorsequencewerecutbyPstIenzyme．108AFIPmarkersweregainedandthefragments were100—2000bp．Meanwhile．33polymorphiclociweregainedandthepropo~ionofpolymorphiclociis30．56％ ．Inthedoublesenzyme digestion，25pairsofdoubleenzymepnmem wereadopted，658clearbandswereamplifiedin50—600 bpand182 polymorphiclociwere gained，whichwere27．6％ ofthetotalamplifiedbands．Basedonthestatisticalnaalysisofpolymorphiebands，itworkedoutthesimilarity , coefficientandgeneticdistanceamongthedi