利用DD-PCR技术研究扬稻6号基因的差异表达.pdfVIP

江苏农业学报(JiangsuJ．of g Sci．)，2008，24(6)：745～750 745 利用 DD—PCR技术研究扬稻 6号基 因的差异表达 张洪熙 ， 戴正元 ， 陈建民 ， 肖 宁一， 李爱宏 ， 刘广青 ， 潘存红 (1．江苏里下河地区农业科学研究所，国家水稻改良中心南京分中心，江苏 扬州 225007；2．扬州大学生物科学与技术学院， 江苏 扬州 225002) 摘要：利用 DD—PCR技术对扬稻6号参与的强优势组合(扬两优6号和两优培九)、明恢63参与的弱优势组 合、R13参与的中强优势组合以及亲本的基因表达进行了分析。根据基 因在杂交组合和双亲中的表达情况分为8 种类型 ，统计30个引物组合在 11个参试材料中的表现 ，获得314组差异条带 ，大小在250bp至 1000bp之间，其 中强优势组合的差异表达带型UNP1、UNF 和ABF．明显低于弱优势组合 ，而DMP2和MON0则明显高于弱优势组 合。用8种类型所 占的比例对各参试材料进行聚类分析 ，结果显示 ，扬稻6号参与的强优势组合和明恢 63参与的 弱势组合明显被分为两类，两者在基因表达模型上存在一定差异。此外，在基因表达水平上探讨了扬稻6号杂种 优势的特殊分子基础。 关键词： 差异显示 PCR；基因差异表达；杂种优势 ；扬稻6号 中图分类号： Q786 文献标识码： A 文章编号： 1000-4440(2008)06-0745-06 Differential Gene Expression of Yangdao 6 by Differential Display PCR Technique ZHANGHong．xi， DAIZheng—yuan ， CHENJian．min ， XIAONing，， LIAi—hong， LIUGuang—qing ， PAN Cun—hong (1．InstituteofAgriculturalSciencesoftheLixiaheDistrict，Sub—centerofNationalRiceImprovementCenter，Yangzhou225007，China；2．CollegeofBio— scienceandBio—technology，YangzhouUniversity，Yangzhou225002，China) Abstract： Geneexpressiondifferencesamonghigh—heterosiscrosseswithYangdao6asmaleparent，middle—hetero— siscrosseswithR13asparentandlow—heterosiserosseswith Minghui63 asparentwereanalyzedbydifferentialdisplay PCR(DD—PCR)technique．Eighttypesofdifferentialexpressionpatternswereclassifiedand314specificbandswith lengthsof250—1000bpwereobtainedbasedongeneexpressioninF1andtheirparentsusing30primercombinations． ThevaluesofUNP1，UNFlandABFlinhigh—heterosiscrosseswerelowerthanthoseinlow—heterosiscrosses，butDMP2 andMONO werehigherinhigh—heterosiscrossesthanthoseinlow—heterosiscrosses．High—beterosiscrossesderivedfrom Yangdao6andlow—heterosiscrossesfrom Minghui63showedsignificantdifferencesingeneexpressionandwereclustered intotwogroupsaccordingtothepercentageofeighttypesofdifferentialexpressionpattern．Molecularmechanism ofYangd—