环境致癌物的计算机预测研究.pdfVIP

第24卷第6期 分 子 科 学 学 报 V01．24No．6 2008年 12月 J0II『iNAI． OF MOU UIAR SCIENCE December2008 [文章编号]1000-9035(2008)06-0393．06 环境致癌物的计算机预测研究 刘 扬 ，王永华 ，李 燕2，刘海映 ， (1．大连水产学院海洋工程学院，辽宁大连 116023； 2．大连理工大学化工学院，辽宁 大连 116023) 【摘 要】 环境致癌物可诱发人类或哺乳动物体内的肿瘤，建立环境致癌物的计算机预测模 型对环境风险评价和生态安全具有重要的意义．通过构建了3780个化合物的数据集，随机选 取其中3024个作为训练集，其余756个作为外部验证集；基于定量构一效关系(Q )方法，采 用逐步判别分析和主成分分析建立数学模型．结果表明训练集非致癌物预测正确率为 86．0％，可能致癌物的预测正确率为88．O％，而采用主成分建模时，非致癌物和可能致癌物的 预测正确率分别为74．2％和73．1％．说明逐步判别分析法的结果优于主成分判别分析．同时 确定了可能致癌物和非致癌物的分子结构参数，阐明了两者结构差异．以上结果为预测和评估 环境致癌物提供参考依据． [关键词] 可能致癌物；非致癌物；分子参数；定量构一效关系 [中图分类号] 0641 [学科代码】 150·30 [文献标识码]A 0 引言 癌症已是当今世界危害人类生命和健康的三大主要疾病之一．环境医学把在人类或哺乳动物的机 体内诱发肿瘤的物质称为环境致癌物．环境致癌物可分为化学的、物理的和生物的三类…1，其中以化学 致癌物的种类最多，危害性也最大． 可能致癌物是一种能够导致或可能导致人或动物患癌症或加重、加速其发生的物质．非致癌物不能 导致或加重、加速癌症在动物或人体的发生．关于环境化合物的致癌性近来受到前所未有的关注，科学 家通过实验手段获得了大量的数据 【．通过实验可以获得可靠的数据，但是需要花费大量的人力、物力 和财力．环境化学分子的数 目极为巨大，而且包括大量的人们未知的化学分子．因此人们不可能对众多 化学品进行一一测定．而利用QSAR研究方法就可以对化学品的生物毒性和环境行为进行预测，并筛选 出具有潜在危害的化学品，这在环境科学研究中无疑是一件极具意义的工作[0．5]．QsAR研究在国际上 是一个相当活跃的研究领域，是环境化学、药物化学、计算机化学及农业化学中的一个前沿课题 ]．在 2O世纪70年代，QsAR法开始在环境毒理学中得到了一定的应用．最初，QSaR研究主要应用在鱼体生 物富集以及其他水生生物的毒性效应方面的研究，并建立了相关模型8【]．近期在鱼体生物富集预测模型 方面也做出了新的探索l99-． 收稿 日期：20(]8427．23 基金项目：国家自然科学基金资助项目；辽宁省海洋与渔业厅项 目(20o7172) 联系人简介：刘海映(1957．)，男，教授，主要从事药物设计研究． E-mail：hyliu@dlfu．edu．a1． 394 分 子 科 学 学报 第24卷 一 2 0 4 6 7 9m n M 巧 玎 墙 ∞ 本文以分子结构参数为基础，建立可预测环境致癌物的数学模型，并确定可能致癌物和非致癌物结 构差异因素，预测和辅助评价可能的环境致癌物和非致癌物． 1 数据和方法 1．1 建模数据 本文的数据来 自于数据库 (http：／／www．fda．gov／Cder／Offiees／OPS—IO／genrepcar．h廿I1)，共选用了 3780个结构高度多样性的分子，其中