我国部分区域链格孢属rDNAITS区序列分析.pdfVIP

安徽农业科学。JournalofAnhuiAgri．Sci．2009。37(6)：2425—2427 责任编辑 金苹 责任校对 吴晓燕 我 国部分区域链格孢属 rDNAITS区序列分析 何劲 ，康冀川 ，谢红艳。，雷帮星 ，文庭池 ，。 · (1．贵州省农业生物工程重点实验窒，贵州贵阳550025；2．贵州省生化工程中心，贵州贵阳550025；3．贵州大学，贵州贵阳550025；) 摘要 [目的]对我国部分区域链格孢属rDNAITS序列进行分析，从而在分子水平上对其进行鉴定。[方法]使用通用引物ITS4和ITS5 对分离自我国部分区域不同寄主链格孢属(AlternariaNees)34个菌株进行 ITS 基因(ITS1-5．8S—ITS2)的PCR扩增和测序。[结果]序列 分析结果表明：5．8SrDNA全长为159bp，保守程度高，参试的34株茵均一致；ITS 区变化相对较大。与A．tenuissima或A．ahernatalO0％ 同源的分离菌株均表现 出对地域和基质的广适性 ；菌株在5．8S／ITS存在的差异，说明寄主本犀科的丁香叶、蔷薇科、茄科等部分植物的 链格孢具有一定的多样性。但 同时也发现ITS 序列标记在链格孢属部分种 间应用有一定的局限性；基于序列ITS1—5．8S—ITS2聚类关系 与其地理来源和寄主相关性不大。l结论lITS序列分析法可为链格孢属的分子鉴定提供理论依据。 关键词 链格孢；序列分析 ；ITS ；5．8SrDNA 中图分类号 S188 文献标识码 A 文章编号 o517—6611(2009)06—02425—03 SequenceAnalysisofITSRegiOnOfrDNA 0fAlternariaNeesfrom SomeAreasofChina 耻 Jingetal (GuizhouKeyLaboratoryofAgriculturalBioengineering，Guiyang，Guizhou55o025) Abstract {0biectivelThestudyaimedtoidentifyAhernariaNeesfromsomeareasofChinaatmolecularlevelbyanalyzingtherDNA ITS sequence．}Method}TheDNAsequencescodingfort}le5．8SrDNAandtheflankinginternaltranscribedspacers(ITS1andITS2)wereampli． fledbyPCR withuniversalprimers ITS4 and I1、s5 and subsequentlysequencedfor34Alternaria isolatedfrom differentareasofChina． 『ResultfSequencesanalysisshowedthat5．8SrDNAwas159bpandnovariationintested34isolates．TherehadvariablessitesinITS ．Thei- solatesthathadsamesequencesasA．tenuissimaorA．ahernataallputupeurytopicitytoareaandhost．Th evariablessitesoftheisolates showedthediversityofAhernariainthehostsofOleaceae．RosaceaeandSolanaceae．AtthesametimethatI couldnotclearlyseparatedthe isolateswasindicated．Th eresultsindicatedthatthephylogeneticrelationshipwerenotcloselyrelatedtothegeographicaloriginandhostsof theseisolates．1ConclusionlThesequenceanalysisofI regioncouldprovidetheorybasisofrtIleidentificationofAhernariaNees． Keywords AhernariaNees；Sequencesanalysis：IrS：5．8SrDNA