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特异PCR方法对枯草芽孢秆菌群的鉴定区分
刘勇李辉李金霞程池
摘 要根据枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆茵和解淀粉芽孢杆菌基因组中3-甘露聚糖酶基因上下
游序列设计3对种特异引物。以中国工业微生物茵种保藏管理中心(CICC)保藏的33株枯草芽孢杆茵、
地衣芽孢杆菌和解淀粉芽孢杆茵作为参考茵株,利用特异PCR方法对3种枯草芽孢杆茵群细茵进行鉴
定区分。结果表明该特异PCR方法能够有效区分枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌和解淀粉芽孢杆茵。
关键词特异PCR;枯草芽孢杆菌群;鉴定区分
中图分类号$852.61+6
subtilis
枯草芽孢杆菌群(Bacillus
group)是枯草甘露聚糖类多糖主链的1,4-13一甘露糖苷键。枯草芽
芽孢杆菌及其近缘种的总称,其包括枯草芽孢杆菌 孢杆菌群中的枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌和解淀粉
(B.subtilis)、地衣芽孢杆菌(B.1icheniformis)、解淀粉芽孢杆菌都能够产生B一甘露聚酶。本文根据枯草芽
孢杆菌、地衣芽孢杆菌和解淀粉芽孢杆菌基因组中
芽孢杆菌(B.amyloliquefaciens)和萎缩芽孢杆菌(B.
atrophaeus)等。枯草芽孢杆菌群细菌能够产生多种代
谢产物,在食品、医药、饲料和农业等领域中具有重 了3对种特异引物,并以中国工业微生物菌种保藏管
要应用价值,因此对其准确鉴定具有重要理论和实 理中心(ChinaCenterofIndustrialCultureCollection,
践意义。 CICC)保藏的33株枯草芽孢杆菌群细菌作为参考菌
PCR)是当今快速准确鉴株,试图通过特异PCR方法对枯草芽孢杆菌、地衣芽
特异PCR技术(specific
定菌种的方法之一,可避免培养方法和生化鉴定方法 孢杆菌和解淀粉芽孢杆菌进行鉴定区分。
的烦琐,在临床诊断、食品检测和土壤微生物鉴定等 l材料与方法
领域广为应用。特异PCR技术不仅可以实现微生物 1.1供试菌株
种的区分,也可实现亚种间的区分,如Torriani(1999)供试菌株33株均为中国工业微生物菌种保藏管
等设计脯氨酸亚氨基肽酶基因特异引物,通过PCR理中心(CICC)保藏菌种。其中枯草芽孢杆菌(B.
delbrueckii
产物大小成功对Lactobacillus
subsp.bul—
gaficus和L.delbrueckiisubsp.1actis两个亚种进行了
区分。Oleg等(2004)和权春善等(2006)利用枯草芽孢
杆菌和解淀粉芽孢杆菌yyaR、yyaO和tetB—tetL基因
顺序的差异设计特异引物,通过特异PCR对二者进
行区分。Idriss等(2002)则根据枯草芽孢杆菌和解淀
粉芽孢杆菌仅一淀粉酶基因差异,通过特异PCR完成
了一些枯草芽孢杆菌和解淀粉芽孢杆菌的区分。 1.2主要试剂
3.2.I.78)是一 DNA聚合酶、dNTP购白天为时代生物有限
B一甘露聚糖酶(B—mannanase,EC Taq
种半纤维素水解酶,能够水解半纤维素主要组成成分
司;其它化学药品均为进口分析纯产品。
1.3培养基
王德圣,中国食品发酵工业研究院,中国工业微生物菌种 营养肉汁培养基:蛋白胨5g/l、牛肉膏3g/l、氯化
保藏管理中心,100027,北京市朝阳区霄云路32号。 钠5g/l,pH值7.0。固体培养基则添加琼脂15g/l。
李辉、李金霞、程池(通讯作者),单位及通讯地址同第一 1.4特异PCR引物的设计
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