我国棉花黄萎病菌基于SSR的遗传多样性分析.pdfVIP

棉 花 学 报 CottonScience 2011，23(4)：369～378 我国棉花黄萎病菌基于SSR的遗传多样性分析 尹志新 ，朱荷琴 ，李志芳 ，冯自力 (中国农业科学院棉花研究所 ／棉花生物学国家重点实验室．河南 安 阳455000) 摘要 ：为 了对棉花黄萎病菌群体的遗传多样性进行研究，以棉花黄萎病菌基 因组DNA为模扳 ，用双 因素和单 因素水平优化 的方法对 SSR反应体系的重要参数进行摸索和优化，建立 了最适反应体系。从 300对引物 中筛 选 出13对 多态性较高 的引物 ，并对来 自我 国 l2个省 96个县 (市)的 170个棉花黄萎病菌株进行 SSR分析。 SSR 图谱 的聚类分析结果将供试菌株划分为 2个群体 ：群体 I有 26个菌株 ，其 中 18个为新疆菌株 ，占 69．23％；群体 II有 144个菌株 ，其 中 138个为 内地菌株 ，占95．83％。新疆菌株与其它省份的菌株存在 明显差 异，SSR指纹 图谱与菌株地理来源存在显著的相关性，而与菌株致病力强弱没有表现 出相关性，但弱致病力菌 株可能更容易发生遗传变异。 关键词 ：棉花 ；大丽轮枝菌；SSR；遗传多样性分析；非加权组平均法 中图分类号：$562．035 文献标志码 ：A 文章编号 ：1002．7807(2011)04—03691O GeneticDiversityofVerticillium dahliaePopulationsofCottoninChinaBasedonSSR Analysis YINZhi—xin，ZHUHe—qin，LIZhi-fang，FENGZi—li (CottonResearchInstitute,ChineseAcademyofAgricultureScience~StateKeyLaboratoW ofCottonBiology,Anyang,Henan 455000，Chnia) Abstract：InordertostudygeneticdiversityofVcrticillium dahliaepopulationsisolatedfrom cotton，usinggenomeDNA ofVer- ticillium dahliaeastemplate，importantparametersoftheSSR reactionsystemwereoptimizedthroughsingle—factoranddou— ble—factoranalysis，andtheoptimalSSRreactionsystem forVerticillium dahliaewasestablishied．13pairsofpolymorphichigh— erSSRprimerschosenrfom 300primerswereusedtoamplifygenomeDNA of170testedisolatesofVerticillium dahliaerfom 96counties(cities)of12provincesinChina．InSSRprofilesoftheclusteranalysis，theseisolateswereclassifiedintotwo groups：GroupIincluded26isolates．18isolatesofthisgroupwerefromXinjiangwhichaccounedfor69．23％：GroupIIinclud— ed144isolates．138isolatesofthisgroupwerefrom theinlandwhichaccountedfor95．83％．Sotherewassignificantdifference betweentheisolatesinXinjiangandotherprovinces．SSRfingerprintingexhibitedthattherewasasignificantcorrelationwith geographicaloriginofisolates，nocorrelationwiththepathogeniciyt，butweakvirulenceisolatesmaybemoreproneto