羟喜树碱结合肽的结合作用分析.pdfVIP

江西 中医学院学报2009年2月第21卷 第 1期 JOURNALOFJIANGXIUNIVERSITYOFTCM 2009Vo1．21No．1 羟喜树碱结合肽的结合f ★ 朱威 张莲芬 雷楗勇 金坚 (江南 教育部重点实验室 无锡 214122) 摘要：目的：对羟喜树碱结合肽进行结合作用分析，为进一 助。方法：使用生物信息学软件对羟喜树碱结合肽序列邋 合肽进行结合作用分析。结果：羟喜树碱结合肽原始序 依据氨基酸可以分为疏水脂肪族氨基酸、疏水芳香族氨基 四个符号来代表四大类氨基酸，对羟喜树碱结合肽原始 xGxxGGGNxGGx。结论：预测羟喜树碱结合肽可能通过形 键的极性不带电氨基酸则可能与羟喜树碱形成氢键，进一 关键词：羟喜树碱；结合肽；保守性模式 中图分类号：TQ464．4 文献标识码：A Tosearchforhomologoussequencemode ZHUWei，ZHANG Lian-fen，LEIJian-yong，JIN Jian MolecularPhamacologicalLaboratory，MedicalInstituteofSol Abstract：Object：Tosearchforhomologoussequencemodeof10一Hydroxylcampotthecine(HCPT)bindingpeptidesandtheirbinding mechanism ，SOastoofferhelpwithresearchesOildecodingtheanticancermechanism ofHCP-F，themechanism underlyingresistanceto HCPTnadthemechanism ofitssideeffects．Method：ThehomologoussequencemodeandbindingeffectsofHCPT bindingpeptides wereanalyzedbybioinformatical software．Result：Th ehomologoussequencemod eoforiginal HCPTbindingpeptidesWaSidentifiedas xxxxxLxPxxxxwhilethehomologoussequencemodeof degeneracyHCPT bindingpeptideswasidentifiedasxGxxGGGNxGGxbyse- quencealignmentanalysis．ThehomologoussequencemodeofHCPT bindingpeptidesconsistedofhydrophobicaminoacidresidues． Conclusion：TheHCPTbindingpeptidesmightform hydrophobicpocketstointeractwithHCPTandunchargedpolaraminoacidresidues withinthehydrophobicpocketswouldenhancethebindingeffectsbetween HCPT and HCPT bindingpeptidesbyfomr inghydrogen bondswithHCPT． KeyW ords：10一HydroxylCamptothecine；Bindingpeptides；Homologoussequencemod e l 研究背景与意义 发现羟喜树碱的抗癌活性最高而毒副作用少 ¨。 羟喜树碱(10-Hydroxylcamptothecine，HCPT)是 羟喜树碱同型药物拓扑特康已被美国FDA批准用 我国天然药物宝库中的一颗耀眼的希望之星。中国 于包括直肠癌、结肠癌、卵巢癌、小细胞肺癌以及骨 科学院上海药物研究所从20世纪6O年代末期开始 髓恶性肿瘤等多种癌症的临床治疗 。但羟喜树 起从我国特有山茱萸 目珙垌科植物喜树 (Camptoth— 碱的抗癌机制、耐药机制以及毒理机制还有待于进 etaacumlnataDecaisne)树皮、树枝 、树叶以及果实 一 步的研究深入阐明。 等大量原料中提取了多种成分进行抗癌活性实验， 2 研究材料与方法 基金项 目：江苏省 fJ生厅科研资金资助课题 (H200625) 作者简