建立反向PCR检测HIV-1整合位点的方法.pdfVIP

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2009往 10月 首 都 医 科 大 学 学 报 0ct.2009 第30卷 第5期 JournalofCapitalMedicalUniversity VolJ30 No.5 [doi:10.3969/j.issn.1006-7795.2009.05.014] · 艾 滋 病 基 础 研 究 及 治 疗 · 建立反向PCR检测 HIV-1整合位点的方法 焦艳梅 画 伟 李 娟 刘志英 陈德喜 李在村 张 彤 吴 昊 (首都医科大学附属北京佑安医院感染科) 高效抗反转录病毒治疗(highlyactiveanti.retroviral 表 1 研究对象情况 Tab.1 Generaldataofthesubjects therapy,HAART)可降低艾滋病的发病率和死亡率,使感 染者血浆 中HIV一1RNA降至常规方法检测不到的水 Item Healthcontrol HIV一1patients Numberofcase l5 24 平 ,但用敏感度高的方法仍可检测到病毒基因和低水 Age/year 42(22~55) 4l(23~55) 平的病毒复制,这是因为存在HIV—I潜伏库,含有整合 Gender/Male:Female 9:6 13:1l HIVDNA的静止性CIM T细胞是最主要的HIV.1潜伏 CD4counts/(cell·IxL ) 一 310(15~895) Virusload/(copies·mL ) 一 26368f415~3902191 库 。SilicianoJD等 报道这种潜伏库的半衰期大概 Note:Thenumbersinthetablearemedians: “一 ”:representsnotdone. 为44个月,这种状态下免疫反应或抗病毒治疗对其不起 ThermalCyelers,美 国),琼脂糖凝胶 电泳仪 (DYY一6C 作用,并且成为抗病毒治疗不能完全清除病毒的主要原 型,北京六一仪器厂),数码凝胶图像处理系统 (Gel 因 1 。因此,研究整合型ⅢV一1及其整合位点对于探 MediaSystemTanon一1600R上海天能科技有 限公司)。 讨HIV的致病机制及最终清除病毒具有重要的意义。 DNA提取试剂盒 (德国QIAgen公司),DNA纯化试剂 反向PCR(inversePCR,IPCR)技术可 以对 已知 盒 (德国QIAgen公司)。标准相对分子质量 DNA(宝 DNA片段相邻的未知序列进行扩增和研究。此方法在 生物工程(大连)有限公司),PCR扩增试剂 Taq酶等 分子生物学研究中应用广泛,可 以检测病毒、转座子等 (上海生物工程技术服务有限公司)。 在基因组中的整合位点,克隆基因的邻接序列以及建立 2)纯化 CD4 T细胞:首先分离外周血单核细胞 基因组步移文库等。作者利用PstI能

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