不同品种组合猪的微卫星基因座遗传变异的研究.pdfVIP

不同品种组合猪的微卫星基因座遗传变异研究。 施启顺 晏光荣 柳小春黄生强 马海明 (湖南农业大学动物科学技术学院，长沙，410128) 摘要为了了解大白、长白、杜洛克及其杂种后代的遗传变异情况，选用位于1—4号染色体上的 与平均日增重及背膘厚QTL显著相关的8个微卫星引物检测计算了7个品种组合的有效等位基因数、 多态信息含量及平均基目杂合度，结果表明这三个参数在纯种中均以大白猪最高，长白猪其次，杜洛克 最低。在杂种中杜×长大最高，其次为长×大、大×长，大×长大最低。反映了这7个品种组合的群内 遗传变异较大，所测微卫星基因座的多态性丰富。 关键词微卫星DNA；有效等位基因数；多态信息含量；平均基因杂合度；猪 研究猪的不同品种及其杂交组合的遗传变异，了解这些品种组合的遗传基础，对于合理利用品种资 源，筛选杂优组合，预测杂种优势均有重要意义。微卫星(micmsatellite)一般由26bp的短核苷酸组成 sequence 核心序列，重复10—20次左右，首尾相连串联分布于整个基因组中，又称简单序列重复(simple repeat，ssR)，由于微卫星具有分布广、多态信息含量高、呈共显性遗传及检测方法快速等特点而被广泛 应用于遗传多样性研究。本文利用分布于1—4号染色体上的8个微卫星引物，研究了7个品种组合的 遗传变异状况。 l材料与方法 1．1试验用猪及DNA样品 本研究所用样品来自衡阳外贸种猪场，涉及3个纯种和4个杂交组合，共102个样品。其中杜洛克 头。从每头猪剪下约19耳组织，放进离心管中，立即冷冻保存。 1．2微卫星引物 本试验选用分布于1—4号染色体上的8对引物。这些微卫星引物已经证实是与显著影响日增重 2’“。引物由丹麦皇家兽 QTL紧密连锁的微卫星标记。其中SW58、SW524还与影响背膘厚QTL连锁”1 医与农业大学分子遗传实验室惠赠。引物信息详见表1。 1．3微卫星检测方法 1．3．1基因组DNA的提取 按参考文献“1的方法提取基因组DNA，分别测定DNA浓度、纯度，将各种浓度DNA统一稀释为 100rig／一备用。 1．3．2PCR扩增 dNTPs 总体积10“中，ddH200．58出，10×Buffer0．7ltl，25raMMgcl20．7斗l，2．0raM 0．3山，引物各 0．5斗l，5u／mTaqDNAase0．15一，lOOng／一DNA0．3斗l，矿物油1滴。PCR反应条件为94℃预变性 伸5rain。 ●基金项目：湖南省科技厅重点项目(01．．974-07)资助。 316Il生国麴翅遗僮直弛研究进屋 衰1 S个徽卫星目i物信息 1．3．3电泳及观测 扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳，电泳电压为120V左右，直至蓝色染料至凝胶最底端。然后银 染，在凝胶观察灯上观察电泳结果并拍照，测量Marker片段和等位基因的迁移距离，按里德伍克公式公 式”1计算片段相对分子质量，判断个体基因型。 1，4统计分析 1．4．1有效等位基因数(他)按下列公式计算： Ne：士 之《 i=1 式中q．为某一座位的第i个等位基因频率，n为该座位等位基因数。 1．4．2 多态信息含量(PIC) 按下列公式计算¨J： n n—I 8 2 PIC 1-(∑q：)一(∑∑2￡谚) 式中q。、吼分别为群体中第i√个等位基因频率，n为等位基因数。 1．4．3平均基因杂合度(H)按下列公式计算”3： ∑(1