绵羊瘤胃细菌阿拉伯糖异构酶基因多样性的初步研究.pdfVIP

中国农业科技导报，2015，17(1)：95—101 JournalofAgriculturalScienceandTechnology 绵羊瘤 胃细菌阿拉伯糖异构酶基因多样性的初步研究 张三燕 ， 马 锐 ， 石鹏君 ， 黄火清 ， 徐 波 (1．江西农业大学生物科学与工程学院，南昌330045； 2．中国农业科学院饲料研究所，农业部饲料生物技术重点开放实验室 ，北京 100081) 摘 要：L一阿拉伯糖异构酶可以催化醛酮糖的异构化反应，将 D一半乳糖转化为 D一塔格糖 ，从而在动物营养与 食品应用研究中获得重视。动物瘤胃是一个特殊的厌氧环境，而瘤 胃微生物含有大量的多糖降解酶的新颖 基因。初步分析了绵羊瘤 胃液中细菌来源的阿拉伯糖异构酶基因的多样性。以饲喂后4h的瘤胃液的宏基因 组为模板，通过兼并PCR技术和内切酶方法获得了61条与已知序列相似性达68％一98％的阿拉伯糖异构酶 基因片段，并对 38条差异片断(相似性低于95％)进行聚类分析。结果表明普雷氏菌来源的L一阿拉伯糖异构 酶基因在绵羊瘤 胃中占有绝对优势 (36／38)，而来 自于Catonellamorbi和Marinilabiliasalmonicolor的L一阿拉 伯糖异构酶基因则数量稀少(2／38)。研究结果不但丰富了L一阿拉伯糖异构酶的基因资源，并确定了普雷氏 菌在绵羊瘤 胃的重要性。 关键词：瘤 胃；D一塔格糖 ；阿拉伯糖异构酶 ；基因多样性 doi：10．13304／j．ny~db．2014．190 中图分类号：Q78，$826 文献标识码：A 文章编号：1008—0864(2015)01—0095—07 PreliminaryStudiesonGeneticDiversityofL．arabinose Isomerasein SheepRumen Bacteria ZHANGSan-yan ，MARui，SHIPeng-jun，HUANGHuo．qing，XUBo’ (1．CollegeofBiologicalSciencesandEngineering，JiangxiAgriculturalUniversity，Nanehang330045； 2．KeyLaboratoryforFeedBioteehnology，MinistryofAgriculture，FeedResearchInstitute，ChineseAcademyof AgriculturalSciences，Beijing100081，China) Abstract：L—arabinoseisomerasecatalyzestheisomerizationreactionfrom D—galactosetoDt·agatose，andhasattracted moreattention due toitsimportance in animal nutrition and food applied research．Animal lumen isa special anaerobic environment， and ulminal microorganisms contain large amounts of novel genes that code for polysaeeharide—degradingenzymes．Thisstudy primarily analyzed thegeneticdiversityofL—arabinoseisomerasein sheepulmenbacteria．Usingthemetagenomeofulmencontentextracted4hafterfeedingastemplate，61L—arabinose isomerasegenefragmentswith68％一98％ identitiesandknownsequenceswereobtainedbyPCR amplificationwith spec