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科学技术
云南文山竹丛枝病的检测及15SrDNA片段序列分析
骆帝谕 王连春
(玉溪师范学院资源与环境学院,云南 玉溪 653103)
摘 要:用植原体16SrRNA基因通用引物P1/P7和RI6F2n/RI6R2,对表现丛枝的竹子植株总DNA进行直接PCRJg~巢式PcR扩增,得到长I.2kb的 目的
片段。经过克隆测序 比较分析,结果表 明其)~ 16SrI—B亚组。
关键词 :云南;竹丛枝;16srDNA
竹是禾本科竹亚科Bambusoideae植物的总称。竹子是具有极高的 司,DNAMarker、Taq酶、Amp、IPTG等试剂购 自北京金式金生物科技有
观赏性的一种经济作物,其形态优美,常作为景观观赏、道旁植被、 限公司。pMD19一T购 自宝生物TaKaRa。
公园植物 [1]。云南文山州地处云贵高原东南部,属于亚热带气候,该 1.2材料总DNA提取
地区水热资源较丰富,年温差小,日温差大,比较适合竹子的生长 。 取材料O.5g,剪碎放于研钵中,加入液氮,研磨3—5次,直至成细
竹丛枝病又名 “扫帚病”, “竹簇叶病”,在韩国、印度以及中 粉状。参照植物基因组DM提取试剂盒的方法,提取植株总DNA干燥后
国许多省市均有报道[2—4]。感病植株生长势弱,出笋减少,严重的病 溶于EBbuffer溶液,于一20。c下冷冻保存备用。
竹常常会枯死,竹材质量严重下降。随着竹林面积迅速扩大,该病的 1.3PeR扩增
危害越来越严重,己成为竹子上最常见的严重病害之一 [1,5]。早期的
选用植原体16Sr1)NA通常用的引物Pl/P7和R16F2n/R16R2进行巢式
研究认为竹丛枝病是有瘤座菌[AciculosporiumtakeMiyake,Balansia
PER扩增:25uL体系,10XEasyTaqBuffer2.5uL ,dNTP2uL,
take(Miyake)Rlara]真菌引起的病害 [6]。然而许多植物丛枝病均被
引物各0.5HL,EasyTaqPolymerase0.25uL,DNA模板1uL。PCR
证实由植原体引起,随着分子生物学研究技术的进步,通过PCR扩增可
反应程序:预变性94~C 5min,变性温度94。C Imin,复性温度48。C
以快速鉴定植物材料中是否含有病原,本研究采拟采用PcR技术对文山
lmin,延伸温度72。C2min,总共30次循环,总延~*lOmin。巢式扩
表现丛枝症状的竹子植株进行植原体分子检测,并对扩增得到的16S
增程序为:预变性94~C 5min,变性温度94。C imin,复性温度55。C
rDNA片段进行克隆及测序,并与已知的竹丛枝植原体16SrDNA进行序
imin,延伸温度72。Cimin30S,总共35次循环。扩增产物在1%琼脂
列同源性比较,确定其植原体株系的分类地位,并初步比较其各株系
糖1XTAE缓冲系统中电泳,每#LDn样3uL,用凝胶成像系统观察并拍照
间的差别。
记录 。
1材料与方法 1.4PCR扩增产物的纯化、克隆、酶切鉴定 以及序列测定
1.
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