陕西地区荷斯坦牛Mx1基因外显子多态性分析.pdfVIP

第 35卷 第 5期 家畜生态学报 Vo1．35NO．5 2014年 5月 ActaEcologiaeAnimalisDomastici M av2014 ’。 。 。 ‘。 ‘。 ‘ 5科学研究2 ． ． ． ． ． 陕西地区荷斯坦牛Mxl基因外显子多态性分析 王风巧，党瑞华 ，黄洁萍，雷初朝，蓝贤勇，陈 宏 (西北农林科技大学 动物科技学院，陕西 杨凌 712100) [摘 要] 牛Mxl基因位于1号染色体上，含有14个外显子，编码 648个氨基酸。研究以346头 陕西地区荷斯坦牛为研究对象，根据GenBank所提供的牛 1基 因序列，设计 15对引物，采用混 合DNA池扩增测序和PCR-RFLP的方法对牛Mxl基 因的 14个外显子进行多态性分析。结果表 明，4个SNPs，分别位于外显子3(g．843330TC，g．843411AG)、外显子4(g．844048CT) 和外显子7(g．851325TC)。其中，外显子4(g．844048CT)为同义突变；外显子 3(g．843330T C，g．843411AG)两个位点的突变分别导致 了异亮氨酸(Ile)向苏氨酸(Thr)、谷氨酸(Glu)向精 氨酸(Arg)的突变；外显子 7(g．851325TC)位点的突变导致亮氨酸 (Leu)变为脯氨酸(Pro)。4个 SNPs位点都存在三种基因型，但纯合子的突变频率较低。4个SNPs位点共构建 了11种单倍型，其 中以H6为最主要的单倍型。结果显示，陕西地区荷斯坦牛Mxl基因存在较丰富的多态性，这将为 Mxl基因结构和功能的研究以及将来在育种实践中的应用提供基础资料。 [关键词] 荷斯坦牛；Mxl基因；SNP；外显子；PCR—RFLP [中图分类号] $811．6 [文献标识码] A [文章编号] 1005—5228(2014)05—0013—05 Nix(myxovir#sresistance)基 因是 由Linden- 牛的Mxl基 因位于 1号染色体上 ，含有 15个 mann等_】在一近交小 鼠品系 A2G小 鼠中首次发 外显子 ，编码 648个氨基酸。目前关于牛 Mxl基因 现，因其能耐受对其它随机交配小 白鼠致死剂量 的 多态性及抗病毒活性的研究主要集 中在 国外具有代 流感病毒感染而命名为 Mx基因。Mx蛋 白是一种 表性的牛 品种上，Mxl基 因还包含 2个剪接亚型 由I型 (a／J3)和Ⅲ型 (入)干扰素诱导产生具有 GT- MxlB[和Mxla[一。Nakatsu等 。在 5个代表性 Pase活性的抗病毒蛋 白[2]。大多数脊椎动物体 内 牛品种 的MxlcDNAs中发现 了 11个 SNPs，构建 有 1～3个 Mx蛋白的不同异构体 ，一般定位于核内 了11种主要单倍型，并在 3，一UTR发现一个 l3bp 或胞质 中。 的片段插入／缺失突变。另外，通过体外重组感染试 Mx蛋 白可在多种动物 的多种类型细胞 中表 验证明，牛Mxl基因具有抗传染性水疱性 口炎病毒 达，对多种病毒具有抗性口]。Mx蛋白已知对 RNA (SVS)的活性 ，且不 同的单碱基突变对病毒抗性有 病毒，如流感病毒 、水疱性 口炎病毒、托高土病毒和 不同的影响。目前 ，对此基因新功能的挖掘 尚在不 汉坦病毒等有抑制作用 ，甚至对 DNA病毒也有一 断研究中，例如是否和奶牛 的乳房炎抗性相关等 。 定的抑制作用，如乙型肝炎病毒_l4]。RNA病毒的感 本试验 旨在通过分析陕西地区荷斯坦牛 Mxl基因 染可以使牛 Mx基 因的mRNA和 Mx蛋 白质表达 的多态性 ，为下一步调查其多态性与体细胞数的关 水平上升_5]。所以，机体 内Mx蛋