缢蛏六群体线粒体DNA-COI基因序列变异及群体遗传结构分析.pdfVIP

维普资讯 第 3O卷 第 3期 海 洋 学 报 Vo1．3O，NO．3 2OO8年 5月 ACTA oCEANoLoGICA SINICA M ay2OO8 缢蛏六群体线粒体 DNA--COI基 因序列变异 及群体遗传结构分析 牛东红 ，李家乐 ，沈和定 ，姜志勇 (1_上海水产大学 省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室 ，上海 200090) 摘要 ：利用线粒体 DNA细胞色素氧化酶亚基 (CoI)基因序列片段对江浙闭沿海地 区缢蛏三个野 生群体 (江苏射阳一WS、浙江象 山一wX，福建霞浦一WP)和三个养殖群体 (江苏射阳一CS、浙江象 山一CX、福建焦城一CJ)的遗传结构进行初步分析。以特异引物进行 PCR扩增，经纯化、测序、同 源序列比对获得长度为 556bp的核苷酸序 列，其 中A+T含量为 66．296／，显著高于 G+C含量。 在缢蛏六群体 98个个体 中共检测 到 了56个单倍 型和 66个核苷酸 多态位点，多态位 点比例为 l1．7 。野生群体的平均核苷酸差异数和核苷酸多样性指数略高于养殖群体，但是野生群体和养 殖群体的单倍型多态性指数均大于 0．9，其单倍型较为丰 富。此外，六群体均有各 自特有的单倍 型，但只有射阳野生群体与其他群体无共享单倍型，具有鉴定该群体的特异碱基序列。遗传距离和 聚类结果显示，养殖群体与象 山野生群体和 霞浦野生群体间亲缘关系较近。 关键词 ：缢蛏 ；线粒体 DNA；CoI；遗传 多样性 中图分类号 ：s917．4 文献标识码 ：A 文章编号 ：0253—4193(2008)03—0109—08 浙江 、江苏三省养殖为多，其产量 占全国的 9O9／6左 1 引言 右 。缢蛏不仅是一种高蛋白、低脂肪 ，富含灰分的 群体遗传多样性水平是评价生物资源的重要指 海味佳品，而且具有滋补、清热、除烦的作用 ]，进 标 ，与生物对环境的适应能力、生长速度 、抗病能力、 一 步研究发现缢蛏的糖胺聚糖提取物对人早幼粒 白 物种的进化等密切相关 。由于线粒体 DNA(mtD— 血病细胞 HL260具有一定抑制作用_8]，且代谢产 NA)复制酶不具备校对能力 ，无核蛋 白保护 ，选择 物的活性与其群体遗传多样性水平密切相关[9]，此 压力小，更加容易受到遗传漂变的影响，其变异在群 外随着缢蛏养殖规模的不断扩大，疾病也频繁发生 ， 体间的分布 比例较大 ]，具备了研究群体遗传变异 死亡较为严重。从分子水平上检测群体的遗传结构 的基础 。因此 mtDNA基因序列核苷酸变异在群体 特征 ，不仅可以了解群体遗传多样性水平和遗传分 遗传学 ，保护生物学，系统发育学，分子生态学等学 化水平 ，为其活性物质的开发提供遗传依据，同时也 科的应用越来越受到 国内外学者的关注 ]，其核 有利于探索疾病发生的内在原因。本文通过分析缢 心问题就是分析 mtDNA序列的多态性 ，而 CoI(细 蛏线粒体 DNA～CoI序列多态性 ，揭示江浙闽沿海 胞色素氧化酶亚基)在物种进化中属于中度变异 ，可 地区缢蛏野生群体和养殖群体遗传多样性等方面的 以用于群体水平的遗传多样性分析 ]。 状况 ，为缢蛏种质资源的管理和保护提供理论依据 ， 缢蛏 (Sinonovaculaconstricta)作 为我 国 四大 为缢蛏种质评价和优异种质筛选及进一步的 良种选 养殖贝类之一，广泛分布于我国沿海 ，尤其在福建 、 育奠定基础 。 收稿 日期 ：2007—05—11；修订 日期 ：2008—02—22。 基金项 目：国家 “863”计划