基于16S rRNA序列初步探讨贻贝属的系统发育.pdfVIP

基于16S rRNA序列初步探讨贻贝属的系统发育.pdf

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基于16S rRNA序列初步探讨贻贝属的系统发育.pdf

研究报告只目∞碍 基于16SrRNA序列初步探讨贻贝属的系统发育 沈玉帮1,李家乐1,牟月军2 (1.上海海洋大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室,上海200090;2.浙江省嵊泗县科学技 术局,浙江嵊泗202450) 摘要:通过比较贻贝属5个物种包括中国的两种贻贝的线粒体16SrRNA基因部分序列,来初步确定它们的 系统发育关系和了解中国沿海两种贻贝的遗传多样性情况。以Perna 建分子系统树。系统发育分析表明,5种贻贝(Mytilus cus)的遗传多样性都较高,但厚壳贻贝的遗传多样性要低于紫贻贝,可能是由于厚壳贻贝过度被渔民开采等 导致厚壳贻贝群体大小降低的缘故。这里系统发育分析为将来进行物种进化、迁移和育种方面的比较研究 提供理论基础。 关键词:贻贝属;16SrRNA;系统发育;单倍型 中圈分类号:Q789 文献标识码:A 文章编号:1000—3096(2009)12—0050—06 线粒体基因组序列已经被广泛应用于系统发育 研究。绝大多数线粒体基因组含有相同数目和相同 类型的基因——2个rRNA基因、22个tRNA基因、 自于亚洲太平洋沿海的厚壳贻贝。加利福尼亚贻贝 13个蛋白基因和一个非编码区[1’2]。与核基因相比, 线粒体基因具有更多的优点,因为线粒体基因有许 及其他地方也有分布,它主要生活在潮间带,个体相 gene),它们能够 多平行进化同源基因(paralogous 对来说比较大[1引。中国沿海的贻贝主要有紫贻贝 使分析更加复杂化。另外,线粒体基因组的基因结 构、遗传密码,以及其他的更高层次的信息在系统发 紫贻贝主要分布于中国北部沿海;厚壳贻贝分布于 生重建中已经作为强有力的工具[3J。16SrRNA基 黄渤海以及东海[14|。对贻贝属不同物种之间的进化 因编码序列可以分为57部分和3’部分,而且每一个 关系到目前还没有完全明确。 部分包括3个功能区域[4]。对16SrRNA基因研究 本研究运用线粒体16S基因部分序列对不同贻 发现它的次级结构提供了非常适合系统发育研究的 贝物种进化关系进行研究,同时初步了解中国紫贻 信息‘5‘。 贝和厚壳贻贝两种贻贝多样性水平和遗传差异,为 贻贝属是所有海洋无脊椎动物中分布最为广泛 贻贝种质资源的利用与保护提供理论依据。 的属之一。不管是在港湾还是海洋环境,不管是在 潮下带还是潮间带,都有分布,而且贻贝已经成为研 1材料和方法 究海洋生物的种群分化和物种形成的一个非常有意 1.1 材料采集与DNA抽提 义的模型。在中国和欧洲许多国家,贻贝已经成为 实验所用的厚壳贻贝为2006年8月采自浙江 重要的养殖经济贝类。该属隶属于软体动物门、瓣 嵊泗县花鸟镇海域的野生贻贝。野生紫贻贝为2006 鳃纲、异柱目、贻贝科。Mytilusedulis、紫贻贝(M. g口zzopro以,2ci口zis)、M.trossulus这3种贻贝广泛 分布于欧洲沿海,并且相互之间发生了一定程度的 收稿日期;2008—10—16l修回日期:2009-03—16 varia— 渐渗,从而产生了地理变异(geographical tion)[6’7]。有人认为地中海的M.gnzzo户,_D祝7zf如Z如 科资助项目(Yll01)I上海市优青项目(B-8101—06—15) 是

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