乌鳢线粒体DN控制区结构分析及遗传多样性.pdfVIP

Classified Index: CODE: 10075 U.D.C: NO: A Dissertation for the Degree of M. Science Structure analysis of mtDNA D-Loop region and the genetic diversity of Channa argu Candidate: Dong xinpei Supervisor: Prof. Kang Xian-jiang Specialty: Cell Biology Academic Degree Applied for: Master of Science University: Hebei University Date of Oral Examination: May, 2014 摘 要 摘 要 本试验所用乌鳢自2012 年9 月至2013 年 11 月，分别取自在河北省白洋淀，山东 省平原县和湖南省洞庭湖三个地区，采集到野生群体（白洋淀、平原县和洞庭湖）乌鳢 标本共计104 尾，养殖群体（白洋淀和平原县）乌鳢标本共计64 尾。经过总DNA 提取、 PCR 扩增后共测序得到乌鳢线粒体控制区序列 168 条，在GenBank 数据库中检索出乌 鳢线粒体DNA 全序列，与扩增获得的序列比对，确定乌鳢线粒体 D-Loop 区的起止位 点，确定乌鳢线粒体D-Loop 区序列全长为905-908bp，长度变异较小。识别了乌鳢线粒 体D-Loop 区的终止序列区、中央保守区和保守序列区，指出了终止相关序列的主体是 TACAT 与其反向互补序列 ATGTA 以及一系列保守序列（CSB-F 、CSB-E 、CSB-D 和 CSB-1、CSB-2 、CSB-3 ）。 本研究通过对白洋淀和平原县地区的乌鳢进行野生群体与养殖群体的对比试验，结 果表明这两个地区的野生群体遗传多样性参数均低于养殖群体。其中白洋淀乌鳢的野生 群体和养殖群体间表现出较大的遗传差异，为两个母系起源。平原县的野生和养殖群体 则表现为差异较小，揭示了两群体间亲缘关系较近。 乌鳢3 个地理群体的遗传多样性表现为： 洞庭湖群体平原县群体 白洋淀群体，3 个乌鳢野生群体间和群体内的核苷酸多样性均低于 0.005，表现为核苷酸多样性较低的 现象。其中白洋淀群体的相关遗传多样性参数最低，这表明在白洋淀野生群体内部的遗 传多样性贫乏。3 个群体内与群体间的平均遗传距离为 0.00328，群体间的遗传距离在 0.001- 0.005 之间，遗传距离较小，显示 3 个野生群体间亲缘关系较近。通过AMOVA 分析，3 个乌鳢野生群体的变异百分比：群体间的变异为31.91%，种内个体间的变异为 68.09%，说明3 个乌鳢群体绝大部分遗传变异发生在种内，并不是群体间。从系统发育 来看，单倍型之间并没有按照单倍型所属群体的分类聚簇，系统发育树的端部分枝支持 度相对较低，表现为不同群体个体相互交错形成复杂的簇群，其主要原因是分枝内部核 苷酸分歧水平相对较低造成的，证明了乌鳢3 个群体间的分化并不明显。Tajima’s D 和 Fu’s 检测种群在进化过程中是否遵循中性进化模式，结果表明不同群体间以及单个群体 的值均未达到显著水平。说明这3 个野生群体并没有经过群体扩增和持续增长模式，并 保持稳定的群体大小。 关键词 乌鳢 线粒体D-Loop 区 养殖 野生 遗传多样性 I Abstract