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高粱褐色中脉分遗传图谱的建立及bmr qtl分析
高粱褐色中脉分子遗传图谱的建立及bmr QTL分析
摘 要
高粱,是仅次于玉米、小麦、水稻和大麦的世界第5 大禾谷类作物。高粱产区辽
阔,用途广泛。除食用外,高粱作为饲草作物和能源作物,正受到科学家们的极大关
注。但是高粱细胞壁中木质素和纤维素、半纤维素等之间相互混杂和交联使细胞壁不易降
解,影响牲畜的消化与营养吸收,增加纤维素乙醇转化成本。叶片中脉颜色与木质素含量
和组成有着密切关系。一般认为褐色中脉(bmr )突变体总木质素含量和木质素单体的组
成比例降低,从而使得细胞壁的可消化性增大,纤维素的水解效率升高,可显著提高饲草
的适口性,增加消化率,并且有助于更高效地将其生物质转化为乙醇,因此受到广泛重视。
目前褐色中脉在玉米中研究的比较广泛,但未曾见到在高粱中与其有关的遗传分析和分子
标记定位研究报道,因此本研究以BTx623 和PI595743 及其F2 后代为材料,应用SSR 分
子标记技术进行多态性筛选。主要结果如下:
1. SSR 分子标记的多态性分析。830 对 SSR 引物对亲本进行筛选,结果表明:有95
对引物在亲本间的扩增产物中检测到多态性,多态性比率达11.45 %。
2. 95 个多态性标记对F2 代190 株植物的SSR-PCR 扩增。统计扩增结果,用Kosambi
作图函数将重组率转化为遗传图距(cM ),应用 MapMaker 3.0 构建高粱遗传连锁图,95
个标记中的85 个构成 10 个连锁群,分别对应于高粱连锁群Sc01 到Sc10,覆盖高粱基因
组总遗传距离1220.1cM。其中Sc01 和Sc08 各有两个小的连锁群。
3. 高粱褐色中脉基因的定位。综合遗传连锁图数据和田间表型资料,应用 SAS 和
Windows QTL Cartographer 2.5 ,采用单一标记分析、单区间和多区间分析方法,检测与褐
色中脉(bmr )基因相关的QTL 位点。结果表明:
(1)通过利用SAS 软件进行单一标记分析,分布于4 条染色体上的16 对SSR 引物与
褐色中脉这一特征紧密相关(P0.05 ),并且这16 对SSR 标记解释了高粱群体表型变异的
范围为2.21%到21.89% 。
(2 )应用Windows QTL Cartographer 2.5 ,单区间作图法(IM )和多区间作图法(MIM )
都确立了与褐色中脉(bmr )相关的基因区域,即bmr QTL 。一个主效bmr QTL ,坐落于
sc01b 上,此外还确立了一个微效bmr QTL ,坐落于sc04 上。QTL 作图的结果与单一标记
分析的结果有着很好的一致性。
高粱的 bmr QTL 分析结果证明多基因区域与高粱的褐色中脉有关,并且初步确立的
bmr QTL 将对高粱褐色中脉bmr 基因的克隆和分子标记辅助育种打下坚实基础。
关键词: 高粱;褐色中脉 (bmr );SSR ;分子遗传图谱;QTL 分析
Molecular genetic mapping of sorghum and
the identification of QTL associated
with brown midrib(bmr)
Abstract
Sorghum is the fifth grain crop just behind maize, wheat, rice and barley worldwide.
Sorghum is able to be planted widely and has an extensive use. In addition to eat, Sorghum is
supposed to be forage crop and energy crop, which caught the close attention of scientist.
However, lignin in the plant cell, connected with cellulose and hemi
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