百子莲生长素受体基因TIR1的全长cDNA克隆及功能分析.pdfVIP

第 33卷第 3期 上 海 交通 大 学 学 报 (农 业科 学 版) Vo1．33NO．3 2015年 6月 JOURNALOFSHANGHAIJ1AOTONGUNIVERSITY (AGRICULTURALSCIENCE) Jun．2015 文章编号：1671—9964(2015)03—0036—07 DOI：10．3969／J．ISSN．1671—9964．2015．03．006 百子莲生长素受体基因TIR1的全长 CDNA克隆及功能分析 邹梦雯，岳建华，张 获，申晓辉 (上海交通大学农业与生物学院，上海 200240) 摘 要：采用 cDNA末端快速扩增(rapidamplificationofcDNAends，RACE)方法获得百子莲生 长素受体 T／R1基因cDNA全长序列，对该序列进行生物信息学分析的结果显示，TIR1基因的 mRNA序列全长为 2235hp；5’非编码区296bp，3’非编码区172bp；该基因的ORF全长为 1764 bp，编码一个含有588个氨基酸的蛋 白。百子莲T豫1推导蛋 白序列与葡萄(V／tisvinifera)、二穗 短柄草 (Brachypodiumdistachyon)、高粱(Sorghumbicolor)，玉米(Zeamays)等植物均具有较高 的同源性，同源性最高的是葡萄，可达 7896／。系统进化树表明，百子莲与葡萄距离最近。由旷螺 旋，随机卷 曲和延伸链组成一个磁状结构，为亲水蛋白，疏水性值为一0．092，在百子莲体细胞胚胎 发生过程中，实时荧光定量PCR结果表明TIR1基因表达量在愈伤组织中含量最低，在胚性愈伤 组织和体细胞胚胎中含量均有所升高，而在体胚幼苗中表达量最高，表明该基因介导的生长素信号 在体细胞胚胎发生过程中发挥着非常重要的作用。 关键词：百子莲；生长素受体基因；T，R1；克隆；基因表达 中图分类号：$682．32 文献标识码 ：A CloningandFunctionalAnalysisofFull—LengthcDNA oftheAuxin ReceptorGene TIR 1frOm A panthuspraecox ssp．orientalis ZOUMeng一伽 7z。YUEJian—hua，ZHANGDi，SHEN Xiao—hui (SchoolofAgricultureandBiology，ShanghaiJiaotongUniversity，Shanghai200240，China) Abstract：TheRNA wasextractedfrom youngleavesofAgapanthuspraecox ssp．orientalisandthefull lengthsequenceOfTIR1cDNA wasclonedbyRACE technique．Bioinformaticsanalysisshowedthatthe fulllengthmRNA was2235bp，including296bpof5’untranslatedregionand172bpof3’untranslated region．Ithadanopenreadingframe(ORF)of1764bp，encodingaproteinof588aminoacids．Thededuced proteinsequencewashighlyhomologouswithsomeplantspecies，suchasVitisvinifera，Brachypodium dist口chy0 ，SorghumbicolorandZeamays．ThehighesthomologyofwasV．viniferawhichreached78 ． Phylogenetictree revealed thatthe evolutionary distance between A．praecox ssp．orientalis and V． iniferawasthenearest．